雷氏乳杆菌的全基因组测序及几株乳酸菌发酵植物原料的功能活性研究

来源 :华东理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:skynan2001
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雷氏乳杆菌Lactobacillus curieae S1L19分离自臭豆腐卤液,已被鉴定出是一株新型菌株,该菌株专利保藏于中国典型微生物保藏中心(CCTCC),保藏号: CCTCC M2011381。  1.本课题完成了对S1L19的全基因组测序工作,采用HiSeq2000平台对S1L19进行全基因组测序,通过Illumina Hiseq2000平台测序,样品S1L19共产出301 Mb数据。基于测序数据组装得到样品S1L19基因组大小约为2.19 Mbp,GC含量39.62%,共29个scaffold,35个contig。基因组组分分析后发现,样品S1L19的基因组含有2,143个基因,总长度为1,928,508 bp,平均长度905 bp,占基因组全长的87.75%。串联重复序列共45个,总长为4,816 bp,占基因组全长的0.2191%。小卫星序列30个,微卫星序列0个。预测到的2,143个基因,其中1,820个基因被赋予了潜在的功能,其中56个编码tRNA,6个编码rRNA。  2.通过薄层层析法检测到S1L19具有产γ-氨基丁酸(GABA)的功能,然后用高效液相色谱法进行了验证。而经过同分异构体干扰的排除,加样实验的验证以及不同衍生化方法的重复实验,进一步证实了S1L19确实具有产GABA的能力。  3.谷氨酸脱羧酶(GAD)是GABA合成途径中的关键酶,在S1L19被注释出的功能基因中并未检测出GAD的存在。根据GAD的氨基酸序列设计兼并引物并以S1L19的基因组为模板进行PCR扩增实验,也没有扩增到目的产物。因此,后续工作将确认的GABA的合成途径。  本课题另一部分内容是雷氏乳杆菌及同样来自于臭豆腐乳液的几株植物乳杆菌发酵植物原料——豆乳、大豆分离蛋白溶液及银杏浆等的生物活性研究。检测发酵产物的抗氧化活性和ACE抑制能力。各菌株发酵后的豆乳和大豆分离蛋白的抗氧化能力、ACE抑制能力和二肽基肽酶Ⅳ(DPP-Ⅳ)抑制率均明显提高,其中,植物乳杆菌S1L12的效果最为明显。
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