农业作为我国国民经济的基础,是一个高风险的弱质产业。受多种因素的影响,农业生产不时会受到巨灾风险的袭击。这类农业巨灾风险不仅来源广泛,且难以预测,造成巨大的经济损失。因此,对农业巨灾风险进行管理,并不断地进行工具创新就显得尤为重要。本文以市场失灵理论、福利经济理论、新制度经济理论和比较制度分析理论为理论基础,阐述了我国农业巨灾现状及传统的农业巨灾风险管理工具,重点分析我国巨灾风险管理中存在的问题：缺乏相关法律法规保障：农民参保意识不强;政府支持力度不够；农业保险公司经营水平有限；农业保险市场有效供给不足;农业巨灾保险基金不完善;新型农业巨灾风险管理工具应用不足。借鉴美国、加拿大、日本的农业巨灾风险管理工具,总结对我国农业巨灾风险管理工具创新的启示。在此基础上,提出我国农业巨灾风险管理工具创新思路：利用农业保险再保险分散农业巨灾风险、完善农业巨灾保险基金、利用巨灾风险证券化分散农业巨灾风险、发展天气指数保险分散农业巨灾风险,并构建新型农业巨灾风险管理工具运行的环境保障。