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大黄鱼(Larimichthys crocea)是我国养殖量最大的海水经济鱼种之一，近年来其病害频发造成的经济损失十分严重。加强对大黄鱼免疫学理论的基础研究，了解其抗病免疫机制，提升防病技术，对于大黄鱼养殖业十分重要。本研究利用RT-PCR和RACE-PCR技术克隆了大黄鱼TLR3、TLR5S、TLR5M、IRF3、IRAK4和IL-1β基因的全长cDNA序列以及部分基因的基因组序列，分析了它们的分子结构，并利用荧光定量PCR技术研究了它们在大黄鱼不同组织的表达谱，以及溶藻弧菌(Vibrioalginolyticus)和病原模式分子LPS、poly I:C免疫刺激后脾脏、血液和肝脏中这些基因在转录水平的表达变化，结果如下：（1）TLR3全长cDNA序列3384bp，5’UTR为65bp，ORF为2730bp，3’UTR为589bp，编码909个氨基酸，有三个主要的结构域，即LRRs、跨膜区和TIR结构域。TLR3基因组包含5个外显子和4个内含子。TLR3在大黄鱼的大部分组织中都有表达，其中在肝脏中的表达量较高，血液中表达量较低；poly I:C刺激可以诱导TLR3基因在脾脏、血液和肝脏中表达量增加，而LPS和弧菌刺激能诱导血液中TLR3mRNA水平的表达量上调，但是肝脏中的TLR3转录表达下调。（2）TLR5S基因全长cDNA序列2286bp，ORF为1929bp，编码642个氨基酸，基因组包含2个外显子和1个内含子；TLR5M基因全长cDNA序列3285bp，ORF为2658bp，编码885个氨基酸，基因组包含4个外显子和3个内含子；TLR5S仅含有LRRs结构域，而TLR5M含有LRRs、跨膜区和TIR三个结构域。组织表达分析发现，TLR5S和TLR5M在大部分组织中都有表达，TLR5S在肝脏中表达量较高而TLR5M在心脏中表达量较高；LPS刺激后TLR5M在脾脏、肝脏与血液中的表达量均上调，而TLR5S仅在脾脏和肝脏中的表达量上调；弧菌刺激后3h TLR5M基因在脾脏中的表达量显著低于对照组，而弧菌刺激后12h和48h TLR5S基因在肝脏中的表达量显著低于对照组。（3）IRF3基因全长cDNA序列2204bp，ORF为1389bp，编码462个氨基酸，含有一个IRF结构域。定量PCR分析发现：IRF3在大部分组织中都有表达，在肝脏中表达量较高；LPS和poly I:C刺激都可以诱导脾脏、血液和肝脏三个组织中IRF3转录表达变化。（4）IRAK4基因全长cDNA序列1817bp，ORF为1398bp，编码465个氨基酸，含有DD和S_TKc两个结构域。组织表达分析发现，IRAK4在大部分组织中都有表达，其中在肝脏中表达量较高；LPS和poly I:C刺激诱导IRAK4基因在脾脏和血液中的表达量上调，而在肝脏中的表达量下调，弧菌刺激后脾脏和血液中IRAK4基因的表达量下降。（5）IL-1β基因全长cDNA序列1295bp，ORF为768bp，编码255个氨基酸，含有一个IL-1结构域。IL-1β基因组包含5个外显子和4个内含子。定量PCR分析发现：IL-1β在所检测的组织中都有表达，在肝脏中表达量最高；LPS、poly I:C和弧菌刺激后24h血液和肝脏中IL-1β基因的表达量都显著低于对照组，而脾脏中poly I:C刺激后6h、12h及血液中poly I:C刺激后3h、6h、48h IL-1β基因的表达量都显著高于对照组。