口腔鳞状细胞癌外泌体差异表达mRNA生物信息学分析

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目的利用转录组分析口腔鳞状细胞癌细胞(Oral squamous cell cancer cells,OSCC)外泌体与正常口腔上皮细胞(Human immortalized oral epithelial cell,HOEC)外泌体mRNA之间的表达差异,为解析口腔鳞状细胞癌的发生和发展机制奠定基础。方法利用高通量测序技术检测CAL-27和HOEC外泌体mRNA表达谱,筛选出差异mRNA,对差异mRNA进行GO(Gene Ontoloty)注释和KEGG富集。结果在CAL-27细胞外泌体中鉴定到44699个mRNA,在HOEC细胞外泌体中鉴定到44761个mRNA,其中,差异表达的mRNA共471条(234个上调,237个下调)。生物信息学分析表明上述差异表达的mRNA参与了口腔癌的生物学调节功能和通路。结论口腔鳞癌细胞及口腔上皮细胞均能产生丰富的外泌体;口腔鳞状细胞癌细胞外泌体与正常口腔上皮细胞外泌体间mRNA表达谱存在较大差异,差异表达的mRNA在肿瘤的发生、发展及转移过程中可能有重要作用。
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