户籍制度是我国一项基本的国家行政制度，事关国计民生，意义重大。随着经济社会的纵深发展，户籍制度改革已成为我国现阶段制度改革中所面临的重大课题之一。科学研究影响农户参与户籍制度改革行为意愿的影响因素，制定科学合理、现实性强的户籍制度改革政策对推进我国城乡户籍制度改革、实现统筹城乡一体化发展具有重要意义。本文在回顾国内外已有研究文献的基础上，借鉴社会学、心理学中研究影响人行为因素的需要层次理论，从众行为理论以及理性行为理论对农户参与户籍制度改革进行了理论分析，形成了农民参与户籍制度改革影响因素的作用原理理论框架。在此基础上，以重庆市为案例，结合重庆市农民参与户籍制度改革的重大实际，从个体特征、经济因素、公共服务、个人偏好、制度因素五个方面归纳和总结了20个影响因素指标形成了《重庆市农户参与户籍制度改革意愿的影响因素调查问卷》。抽样重庆市“一小时经济圈”、“渝东南翼”和“渝东北翼”部分区县进行实地调研，共获取有效问卷311份。运用logit二元回归模型对农户参与户籍制度改革的影响因素进行分析，研究结果显示：个体特征因素方面：性别、年龄和社会职业三个变量在模型中没有通过显著性检验，婚姻状况、家庭规模对农民转户意愿具有负相关性影响，教育程度对农户转户意愿具有正相关性影响；家庭经济因素方面：家庭收入因素对农民转户意愿影响不显著，家庭支出比重对农民转户意愿有显著的负向影响，土地补偿收入对农民转户意愿有正显著性影响；个人偏好影响方面：故土情结、个人信仰、城乡生活方式差异三个因素对农民转户意愿均没有显著影响；公共服务方面：住房保障状况、就业再就业培训、子女就近入学以及便捷程度三者对农民转户意愿均有显著的正影响，城镇公共服务设施，医疗卫生服务对农户转户意愿没有显著性影响；政策方面：户籍政策、计划生育优惠政策两项影响因素对农转户意愿没有显著性影响，社会保障制度对农民转户意愿具有显著的正向影响。最后，根据研究结论，本文分别从户籍制度政策设计、政策执行以及农户最关心的社会保障制度、公共服务体系建设等方面提出了相关政策建议，为增强户籍制度改革政策设计的科学性、系统性、现实性和针对性提供借鉴参考，推动我国城乡户籍一体化建设又好又快发展。