不同分子流行病学技术对结核分枝杆菌分型意义的比较性研究

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我们研究的目的是对359株结核分枝杆菌分别应用4种基因分型方法进行分型,就其分辨率及稳定性进行比较,选择出一种适合中国国情的结核分枝杆菌基因分型的方法,广泛应用于流行病学研究,更有效地预防和控制结核病在中国的传播和流行.材料和方法一、研究的标本359株结核分枝杆菌菌株,165株来自于1997年山东省结核菌耐药检测,30个县结防所提供的结核分枝杆菌菌株,115株是2001年费县和沂水两个县结防所提供的结核分枝杆菌菌株,培养基是酸性改良罗氏培养基,79株是山东省胸科医院临床微生物实验室提供的结核分枝杆菌菌株,培养基是12B液体培养基.二、方法1、提取DNA:在BSL3实验室,严格按照无菌操作进行.2、IS6110指纹图谱法.3、标准的结核分枝杆菌MIRU-VNTR分型法.4、准的结核分枝杆菌Spoligotyping分型法.5、主要基因组(major genetic group)分型法.6、Hsp65菌型鉴定.研究结果1、359株结核分枝杆菌通过MIRU分型法得出结果:MIRU分型法鉴定出111种基因型,70种独特型,41个Clusters,簇的大小范围为2-114株菌株,最广泛的菌株是山东簇(N=114,31.75%),MIRU Genetype是223325173533.2、359株结核分枝杆菌通过Spoligotyping分型技术得出结果:Spoligotyping鉴定出33种基因型,22种独特型,11个Clusters,簇的大小范围为2-300株菌株,最广泛流行菌株是北京家族(N=300,83.57%),Spoligotyping是0000 0000 0003 771.3.、IS6110 RFLP指纹图谱分型结果:359株结核分枝杆菌,只有352株有指纹图谱结果,7个菌株没有拷贝数,用Hsp65基因测序的方法鉴定为结核分枝杆菌复合物.IS6110 RFLP指纹图谱带按照100%完全相同定义为一簇(Cluster),352株菌株鉴定出312种基因型,284种独特型,28个Clusters,簇的大小范围为2-4株菌株,IS6110 RFLP指纹图谱带按照90%相似性定义为一簇(Cluster),352菌株鉴定出167种基因型,93种独特型,74个Clusters,簇的大小范围为2-21株菌株,4、流行病学联系与分型结果比较:11株有流行病学联系的菌株,MIRU分型法11株结核分支杆菌分别属于4个Clusters,而IS6110RFLP分型法则只有4株菌属于一个Cluster,其它菌株至少有一条带的差别(2-3条).11株菌株9株Spoligotyping编码是0000 0000 0003 771属于北京家族,另外2株Spoligotyping编码是7777 6737 7760 771.5、Major Genetic group分型法:359株结核分支杆菌306株菌株属于Group1,52株菌株属于Group2,只有1株菌株属于Group 3.
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