城市公共交通是城市基础设施的一个重要方面，是城市经济发展的“动脉”，可以保障居民的基本出行需求，与居民日常生活密切相关，是联系社会生产、流通和人民生活的纽带，对社会经济发展和城市建设具有重大的基础支撑作用。随着我国社会经济的不断发展，新型城镇化建设进程也不断加快，随之而来的交通拥堵、资源浪费等问题不断涌现，大力发展城市公共交通能够提高交通资源利用率、缓解城市交通拥堵，同时也通过改善城市人居环境来满足人民群众多样化出行需求，成为提升城市综合竞争力的关键。因此，大中城市公共交通运输系统效率的好坏直接影响着我国社会的和谐和健康运行。公共交通运输系统在我国经济运行和社会发展中发挥着不可或缺的作用。因此，如何客观、公正的评价公共交通运输系统的效率以及分析影响效率的因素，提出可行的政策建议已成为学界和业界共同关心的重要课题。在目前我国大力发展城市公共交通的政策环境下，尤其是在现阶段我国供给侧结构性改革战略实施的背景下，对我国大中城市公共交通运输系统的效率进行测度，并对影响公共交通运输系统效率的影响因素进行分析，对于提升我国大中城市公共交通运输系统的整体效率具有非常重要的理论价值和现实意义。　　本文以2010-2015年我国36个大中城市的公共交通面板数据为样本，基于非参数估计的DEA模型、SE-DEA模型，对公共交通运输系统的综合效率、技术效率和规模效率进行分析和评价；基于Malmquist全要素生产率指数法对公共交通运输系统及其子系统的效率变化和城市间差异性变化进行研究。研究结果表明：通过静态视角测度的综合效率、技术效率和规模效率可以看出，在我国城市化进程不断加快的大背景下，我国大中城市公共交通运输系统的综合效率、技术效率和规模效率整体都达到了中等偏上的水平，但是各城市之间还存在一定的差距，公交和出租车子系统的效率差异显著。通过动态视角测度的Malmquist全要素生产率可以看出，我国36个大中城市公共交通运输系统的全要素生产率近年来总体上呈现波动下降趋势，公共交通运输系统综合效率还有待提高，对城市公共交通运输的相关人员、车辆和道路等的投入还没有发挥出最大的潜力。　　本文采用DEA-Tobit回归分析法对我国大中城市2010-2015年间的城市公共交通效率影响因素进行了实证分析，并通过进一步分析社会经济发展、城市发展、公共交通投资、交通基础设施等因素对公共交通的影响程度，探讨影响公共交通运输系统效率的指标，Tobit回归模型的实证结果表明，社会经济发展水平、公交线路网络密度和是否开通轨道交通与城市公共交通运输系统效率呈负相关；城市发展水平、公共交通投资和单车拥有道路面积与城市公共交通运输系统效率呈正相关。在一定程度上解释了不同地区公共交通效率存在差异的原因，一些经济发达地区虽然具有良好的城市公共交通运输基础设施和技术支持，但是经济发展水平的提高和城市公共交通运输体系规划不匹配等矛盾，给现在的城市公共交通运输系统带来众多约束。相比之下，中西部一些经济欠发达城市，居民出行观念较为经济，反而会促进城市公共交通运输系统效率的提升。　　最后，本文从全面推进公交都市建设、提升城市公共交通服务品质和建立互联网+职能公共交通等方面，提出了提高我国城市公共交通运输系统效率的政策建议，以期为交通主管部门有针对性地制定政策提供依据，以不断改进提升大中城市公共交通效率。