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本研究在通过实验和分子模拟方法共同解析脂肪酶和周围微环境的应答机制及活性变化规律方面取得了良好的进展。构建了不同浓度的甲醇溶液,通过实验和模拟的方法研究其对Yarrowia lipolyticalipase Lip2脂肪酶构象的影响。脂肪酶整体构象的回旋半径分析、实验酶活数据、主成分分析表明:在甲醇的作用下,脂肪酶整体发生了膨胀,三级结构发生了变化。荧光、紫外实验及溶剂可及面积计算结果表明:维持蛋白原有三级结构的主要作用力——疏水相互作用遭到甲醇的破坏,促使脂肪酶发生了膨胀,三级结构破坏,但二级结构变化不大。水和甲醇在脂肪酶表面的分布情况表明:随着甲醇浓度的增大,部分甲醇分子进入到了脂肪酶分子内部,从另一个侧面印证了蛋白的溶剂可及面积的变大及芳香族氨基酸的微环境的变化。通过对Lip2脂肪酶的盖子闭合性的分析发现了LIP2脂肪酶可能存在两个盖子结构,即除了Thr88-Leu105的盖子区域,Lip2脂肪酶还存在一个具有较大柔性的区域Phe274-Leu290。