我国大肠杆菌O157和猪链球菌脉冲场凝胶电泳分析

来源 :中国疾病预防控制中心 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liuzujnrui
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本研究使用PulseNet Asia Pacific推荐的、美国CDC发展的PulseNet实验方法,初步建立了我国大肠杆菌0157:H7 PFGE数据库。数据库包括我国历年分离的产志贺毒素的大肠杆菌0157:H7 245株,不产志贺毒素的大肠杆菌0157:H7 4株,非H7大肠杆菌0157 51株,获得161种带型。本研究建立的数据库,具有和其他国家的PUlseNet数据库共享的潜力。我们利用PulseNet的技术发展、优化了猪链球菌PFGE分子分型方法,提出了新的分析方案,包括胶块的制备、内切酶的选择、电泳条件等。使用DNAStar的Mapdraw软件对猪链球菌基因组序列进行分析,发现在242种内切酶中,SwaI、SmaI、ApaI种酶比较适合。通过对34个血清型共100株菌的分析,发现使用SwaI可获得59种带型,使用SwaI可获得54种带型,使用ApaI可获得43种带型。其中以SwaI的分辨率最好。因此,本研究提出了猪链球菌的SwaI PFGE分析方案,并对条件进行了优化。和以往的方法相比,时间更短、图像更清晰、更具有可重复性,基本具备推广的条件。
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