刺盘孢属(Colletotrichum)是Corda于1831年建立的,是全球性分布的植物病原菌,可引起多种草本及木本植物采前及采后病害,导致大量的经济损失。自刺盘孢属建立以来,其分类地位一直处于不断变化的状态。我们认为对西南地区药用植物上该属开展系统的研究是有必要的。2017年9月至2019年8月期间,从中国西南4个省份(广西省、贵州省、四川省和云南省)采集到具典型病害症状的药用植物标本500余份,从其中的77份标本上分离到刺盘孢属真菌171株,寄主包括29科39种药用植物(百合科-竹根七、紫萼;冬青科-冬青;豆科-鸡血藤、龙须藤;杜鹃花科-杜鹃;胡椒科-假蒟;葫芦科-马交儿;姜科-莪术、姜、艳山姜;蜡梅科-蜡梅;木兰科-野八角;木犀科-木犀、女贞;葡萄科-翅茎白粉藤;漆树科-芒果;茜草科-栀子花;蔷薇科-枇杷、石楠;茄科-辣椒;忍冬科-荚蒾;三白草科-蕺菜;山茶科-茶树、山茶;山茱萸科-花叶青木;石蒜科-水鬼蕉;苏铁科-叉叶苏铁;天南星科-海芋、合果芋;五加科-八角金盘、常春藤、幌伞枫;苋科-牛膝;小檗科-十大功劳;芸香科-香橼;樟科-香樟;紫金牛科-紫金牛;棕榈科-袖珍椰子),分离到的刺盘孢属真菌分属于8个刺盘孢复合种(Acutatum、Boninense、Destructivum、Gloeosporioides、Magnum、Orchidearum、Spaethanium、Truncatum),其中超过50%的菌株属于Gloeosporioides复合种。通过多基因(ACT,CAL,CHS-1,HIS3,GAPDH,ITS和TUB2)联合和Ap Mat基因系统学分析,并结合形态学研究,共鉴定出25个种,其中14个新种。14个新种分别为C.citrus-medicae,C.disporopsis,C.fatsiae,C.gardeniae,C.hostae,C.huaxiense,C.ilexsis,C.ligustrumae,C.osmanthusae,C.piper-sarmentosumae,C.rhododendronsis,C.rosaceae,C.yangzhouense,C.zingiberae;11个已报道的种为C.boninense,C.fructicola,C.grevilleae,C.jiangxiense,C.karstii,C.liriopes,C.plurivorum,C.siamense,C.tabacum,C.truncatum,C.vittalense。其中C.siamense为优势种(30株)。本研究首次系统的对西南地区药用植物上的刺盘孢属真菌进行分离和鉴定,基本弄清了广西、贵州、四川和云南4省药用植物炭疽病病原种类。