基于探针熔解曲线的常见副溶血弧菌血清型分子鉴定方法研究

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血清型作为众多病原菌的一种生物学表型,在致病菌的鉴定、传染病的暴发调查和溯源等方面具有重要作用。2011-2016年,中国食源性疾病暴发监测系统的数据表明,副溶血弧菌是引起食源性疾病的主要病原菌。目前副溶血弧菌的血清型鉴定方法主要依赖传统的玻片凝集实验,该方法耗时耗力;近期报道的聚合酶链式反应分型法仅能完成副溶血弧菌的O抗原鉴定,覆盖的检测种类不全。因此建立快速、高效、高通量的新型副溶血弧菌血清型鉴定方法具有重要意义。本研究首次开展基于探针熔解曲线技术的副溶血弧菌血清型分子鉴定,具体研究结果如下:1、根据副溶血弧菌的O抗原特异基因建立了基于探针熔解曲线技术的副溶血弧菌O抗原分子鉴定方法,可在3.5小时内一管同时鉴定公认的12种O抗原血清型。方法的最低检出限范围为0.1-1.0ng/μL,其特异性和重现性实验结果表明:鉴定12种O抗原均无交叉反应,重现性实验的批内差和批间差的变异系数均小于1%。鉴定426个样本的评估实验结果表明,与传统玻片凝集实验法比较,其灵敏度、特异度和一致性均为100%,Kappa值为1.0。2、根据本课题组前期工作获得的关于10种常见K抗原的特异基因序列,建立了基于探针熔解曲线技术的10种常见副溶血弧菌K抗原分子鉴定方法,该方法可在3.5小时内一管同时鉴定常见的10种副溶血弧菌K抗原.方法的最低检出限范围为0.1-1.0ng/μL,其特异性和重现性实验结果表明,鉴定10种K抗原均无交叉反应,判读结果的批内差和批间差的变异系数均小于1%。鉴定481个样本的评估实验结果表明,与玻片凝集实验法比较,其灵敏度、特异度和一致性分别为98.9%,100%和99.0%,Kappa值为0.79。综上所述,本研究的两套副溶血弧菌血清型分子鉴定方法,可分别单管完成12种副溶血弧菌O抗原和常见的10种副溶血弧菌K抗原的鉴定,为副溶血弧菌血清型的鉴定提供一种快速、准确、简便和高通量的新型方法,这对该致病菌的监测、预防、控制具有重要意义。
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