近年来,随着经济发展和人们生活水平的提高,越来越多的消费者倾向于选择更加健康优质的绿色农产品。然而,相较于普通农产品,绿色农产品的生产、加工等环节都要求更高的技术与资金投入。企业作为追逐经济利益的主体,在缺乏外界干预时,往往具有投机思想而向市场供应不合格的绿色农产品。因此,为保证绿色农产品市场健康发展,政府需介入其中,并采取有效措施对企业的生产行为加以引导。显然,在消费市场倒逼压力及政府相关政策压力下,农产品供应商必须向消费者供应能够满足其消费需求的高绿色度农产品。事实上,绿色农产品从产到销往往涉及多个利益主体,主体间的合作程度会影响供应链成员及整个供应链的利润。基于以上现实背景,本文研究了绿色农产品供应链主体的合作问题。本文系统梳理了国内外研究现状,在理论分析基础上,结合现实情况,以绿色农产品生产商和加工商构成的二级供应链为研究对象。考虑到在整个过程中,农产品绿色度会随时间推移而不断发生变化,因此引入微分博弈理论,从动态视角出发,建立了在纯市场作用和政府监管下,绿色农产品供应链上的两类主体在非合作模式、成本分担模式及协同合作模式下的微分博弈模型,并分别考察了它们在不同模式下的最优定价和绿色努力策略,以及相应策略下的绿色度和所得利润情况。继而通过数值算例,分析相关参数对农产品绿色度和利润的影响。最后,根据供应链成员对最终农产品绿色度的贡献程度改进基本Shapley值法,从而使协同合作下的供应链整体利润得到更加公正合理的分配,以保障合作关系的长期稳定性。经过研究,本文得到的主要结论有:(1)无论是在纯市场作用下,还是在政府监管下,从非合作模式过渡到成本分担模式,绿色农产品价格与加工商的绿色努力程度不变,但生产商的努力程度提高,最终使农产品绿色度及供应链利润均得到改善。协同合作模式下的农产品价格最低,当满足一定条件时,该模式下主体付出的最优努力程度、最终农产品绿色度及供应链利润均大于其他两种模式。(2)消费者越倾向于选择绿色度高的农产品、政府监管对绿色农产品市场需求的影响越大,越能提高供应链主体参与合作的积极性,同时它们也会向市场供应具有更高绿色度的农产品;协同合作模式下,价格加成系数不对绿色度和供应链利润造成影响,而在其他两种模式下,价格加成系数在小范围增加时,会使供应链利润减少,继续增加至一定程度,则会呈现出相反的变化特征;在满足一定条件时,协同合作模式下,即使政府补贴(处罚)系数较小,供应链主体也会选择付出更高的绿色努力程度。(3)在考虑供应链主体对最终农产品绿色度贡献程度的基础上,对基本Shapley值法进行改进,可以使协同合作模式下的供应链整体利润得到更加公正合理的分配。也就是说,在这种分配方式下,贡献较大的成员能够分得更多利润,而贡献小的一方分得的利润相应减少,从而促进合作长期稳定发展。