建立市场经济体制的有效途径就是发展与之配套的农民专业合作社,农民专业合作社是介于团体和公司之间的一种相对松散的组织形态,互相合作是合作社社员交流的纽带,同时合作社是独立法人,具有相对独立性。农民专业合作社能够在家庭联产承包责任制这一原有基础不动摇的条件下,提高农民的积极性,从而实现农业的集约化、产业化的变革。合作社与公司的各自目标不同,就决定着他们是不同的经济组织,合作社的最高目标就是服务于其社员,这就从根本上说明合作社治理和公司治理并不相同,公司治理作为当今法人治理的最高成就,取得的硕果,值得合作社进行借鉴和学习。形成一个与公司相类似的组织结构,即社员大会、理事会和监事会相互制衡的三权分立之形式,其中社员大会不能等同于公司里的成员大会中心主义,以免被管理人控制整个合作社,达不到该有的效果。如何更好地发挥社员大会、理事会和监事会的职能,需要对我国当下的合作社现状进行剖析,从而更好地完善农民专业合作社治理。第一部分,导论。首先对我国农民专业合作社治理的研究背景、目的和意义进行阐述;其次是文献综述和创新之处进行说明,文献综述主要是对国内具有代表性的著作和期刊进行介绍,创新之处主要从所有者、经营者、监管者三个方面入手;最后对本文的基本思路和研究方法进行相关说明。第二部分,农民专业合作社治理的法律困境。笔者在搜集网络资源的情况下,对克山县仁发农机合作社进行了电话采访,同时也对灌云县数家农民专业合作社进行实地调研,发现合作社在治理方面存在很多共性问题,从三个角度来抽离出问题所在,一是社员大会产权虚置、股权设置不合理;二是理事会设置中缺乏激励机制、职员素质低;三是监事会方面,政府的过多介入,监事会职能未能有效发挥。第三部分,农民专业合作社治理的法理分析。首先将农民专业合作社的治理与公司治理进行科学有效的比较,进而可以借鉴公司治理的优势之处;再次从所有者、经营者、监督者三个方面,在一定的理论基础上分析了农民专业合作社困境的根源所在。第四部分,农民专业合作社治理的法律出路。该部分对于前文提出的问题,在一定的理论基础上,从所有者、经营者、监管者三方面给出具体的对策,以此来完善农民专业合作社的治理。