狂犬病是由狂犬病病毒引起的致死性的人畜共患传染病,世界范围内广泛分布,每年超过55,000人死于狂犬病。亚洲作为一个狂犬病流行严重的地区,每年人狂犬病发病数都居高不下,而多年来中国也是仅次于印度的狂犬病第二高发国家。新的狂犬病流行时期里我国狂犬病疫情又进入了新的流行高峰期,每年都有超过2千人死于狂犬病,而且疫情区范围也呈现逐步扩大的趋势,造成了严重的公共安全和卫生问题。以往研究表明,系统进化分析对于疾病的流行病学研究提供了深层次的分子学证据,对于揭示疫情的发生发展起到不容忽视的作用。因此本研究通过广泛的采样和数据收集,使用全面的系统地理学分析,对亚洲背景下中国的狂犬病毒的进化进行探讨研究,并进而深入了解中国狂犬病毒的系统进化与分子流行病学的联系。研究结果发现当前亚洲范围内狂犬病病毒基因1型存在有6个不同的支系,来自不同国家的狂犬病病毒有着地域聚集性分布的特征,也就是说分子流行病学上的联系更多的是局限在区域范围内;国家间狂犬病毒的传播主要发生在邻近地区;这些对于国家间狂犬病的防控有一定的借鉴意义。当前环境下,中国内部狂犬病病毒显示出独立于周围其他国家狂犬病病毒而自行进化的特征,除极个别的基因交流外,中国狂犬病病毒的多样性主要由种群分化决定的;系统地理学结果发现不仅是邻近省份之间,许多相隔较远的省份间也存在着流行病学上的联系,亦即这些省份之间存在着病毒的传播扩散:各狂犬病疫情区之间存在着横向和纵向的联系,这也作为当前中国狂犬病发病区域范围快速扩大的原因之一。这些对于有效制定狂犬病的预防控制起着很大的科学依据。