肝癌细胞中OY-TES-1基因启动子甲基化状态分析

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:naonao19890925
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目的:预测OY-TES-1基因的启动子区域,了解肝癌细胞中OY-TES-1基因启动子甲基化状态及甲基转移酶抑制剂对肝癌细胞OY-TES-1基因甲基化的影响。方法:(1)运用生物信息学在线软件,获取OY-TES-1基因的5’上游序列,预测启动子区域、转录因子结合位点和CpG岛。(2)提取6种肝癌细胞株(QGY-7703.BEL-7404.BEL-7402. QGY-7701.SMMC-7721和HepG-2)基因组DNA,应用亚硫酸氢盐测序法(bisulfite-sequencing PCR,BSP),分析肝OY-TES-1基因启动子的甲基化状态。(3)用2μmol/L甲基转移酶抑制剂(5-Aza-CdR)培养BEL-7404 72小时,提取基因组DNA,应用BSP分析OY-TES-1基因启动子的甲基化状态,比较干预前后OY-TES-1启动子甲基化状态的改变。结果:(1)生物信息学分析结果显示,OY-TES-1启动子区域位于—184bp-67bp,含多个潜在转录因子结合位点(9个SPl,4个GCF和1个CREB);OY-TES-1全长序列存在两个CpG岛,第一个CpG岛位于一200bp-+126bp,第二个CpG岛位于+137bp-+587bp。(2)根据BSP结果计算OY-TES-1启动子总甲基化频率,6种肝癌细胞株的甲基化频率分别为51.25%(QGY-7701).62.08%(HepG-2). 76.67%(BEL-7402).79.58%(SMMC-7721).87.08%(BEL-7404)和87.92%(QGY-7703)。(3)BEL-7404经5-Aza-CdR处理后,OY-TES-1基因启动子的总甲基化频率由干预前的87.08%下降至21.25%。结论:OY-TES-1基因启动子含有CpG岛及潜在转录因子结合位点;所检测肝癌细胞中OY-TES-1基因启动子呈较高的甲基状态,甲基转移酶抑制剂能显著降低肝癌细胞株OY-TES-1启动子甲基化频率。
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