CLA突变后植物乳杆菌P8 rpoC和rpoD的基因序列和转录水平分析

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共轭亚油酸(conjugated linoleicacid,CLA)是具有共轭双键的十八碳脂肪酸的总称,有许多生理功效,在医疗和保健方面有很大的应用价值。CLA是亚油酸异构酶催化生成的,受转录因子的调控。调控的转录因子有σ70和β`,均是与-10区结合,共同调控着基因转录的起始,其中基因rpoC编码蛋白β`,基因rpoD编码蛋白σ70。但σ70和β`调控亚油酸异构酶的机制目前尚不清楚。为了了解CLA突变后是否引起转录因子σ70和β`的基因即rpoD和rpoC的基因序列和表达水平的改变,本研究是以野生型和5个CLA突变的的植物乳杆菌p8(9-6,9-7,9-8,9-25和9-26)作为研究对象,使用分子生物学方法分别获得植物乳杆菌p8突变菌株和野生菌株rpoC和rpoD并对其序列分析;用实时荧光定量PCR的方法分析rpoC和rpoDmRNA的表达水平。结果表明,5个突变菌株的rpoD未发生任何突变。rpoC与其所编码的氨基酸序列却有不同的突变。基因突变序列中9-6有一个突变位点,9-7有四个突变位点,9-8有三个突变位点,9-25有七个突变位点,9-26有五个突变位点。其编码的氨基酸序列也有所突变,其中9-6有一个突变氨基酸,9-7有一个突变氨基酸,9-8有两个突变氨基酸,9-25有六个突变氨基酸,9-26有五个突变氨基酸。根据在线网站和软件对β`结构域预测分析,发现β`有4个结构域,分别为:coiledcoilregion(折叠区域)、RPOLA-N(RNA polymeraseIsubunitAN-terminus)、Pfam:RNA-pol-Rpb1-4(RNA polymerase Rpb1,domain4)和Pfam:RNA-pol-Rpb1-5(RNA polymerase Rpb1,domain5),并发现40、97、627、643、690位的突变位点并不在预测的结构域中,可以肯定这几个突变的氨基酸位点对于β`的活性并没有产生影响。而254、261、349、367这几个突变的氨基酸位点虽然在结构域RPOLA-N和RNA-pol-Rpb1-5中,但是由于没有人对植物乳杆菌β`的三维结构做过分析研究,没有可参考的模板,所以254,、261、349、367这几个突变的氨基酸位点虽然在结构域中,但是否在活性中心,是否对蛋白的活性有影响都不能确定。对野生型和突变型的rpoC和rpoD的mRNA进行荧光定量分析,发现野生型和突变型的rpoC和rpo DmRNA表达存在显著差异性,rpoCmRNA与CLA的突变呈正相关性,rpoC mRNA与CLA的突变部分呈正相关。
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