纤溶酶QK的溶栓活性与氨基酸位点的相关性及其蛋白晶体结构的初步研究

来源 :武汉大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dejia2000
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
近年来,随着人们的生活水平不断提高,心脑血管疾病的患病率不断增加。据悉,全球每年有1200万人死于心脑血管疾病,受其影响而生活不便的人们更是不计其数。心脑血管疾病最大的病因在于血管栓塞,治疗的关键在于疏通血管保持血液流动畅通,目前临床上的治疗药物主要是急救药,存在药效短、有出血副作用等缺点,新型溶栓药物的研发已是大势所趋。本课题研究的是一种极具潜力的新型溶栓药物——枯草杆菌纤溶酶QK。它是一种与纳豆激酶高度同源的丝氨酸蛋白酶,能靶向降解血栓骨架——交联纤维蛋白,具有较高的溶栓活性和较长的药物半衰期,作为治疗心脑血管疾病的新型溶解血栓药物,具有良好的应用前景。在王业富教授课题组前期的研究中,通过挑选野生型菌株、优化发酵条件等方式,得到了提高QK纤溶活性的方法,并通过凝胶过滤层析等方式进行纯化,得到了纯度高于95%的纤溶酶QK。纤溶酶QK在生产工艺上已较为成熟,但是我们对于其溶解血栓的分子机制尚不清楚。在此背景下,该课题探索了QK的氨基酸位点与酶活之间的相关性,并初步解析了纤溶酶QK的蛋白晶体结构,探索了蛋白结构与溶栓功能之间的关系,为纤溶酶QK的药物开发提供理论基础,为心脑血管疾病的防治提供新的用药选择。研究内容归纳为以下四个方面:(1)从不同来源的枯草杆菌纤溶酶粉中筛选到15株枯草芽孢杆菌菌株,以这15株菌株的总DNA为模板,扩增它们的QK基因,测序后与Gen Bank上已提交的QK基因所对应的蛋白序列(Gene Bank编号:CAE18180.2)进行比对,找出氨基酸差异位点。根据突变位点的不同把15株菌株分为A、B、C、D四组,其中,A组的突变位点为S184T;B组的突变位点为Q90K,N193S,S236T,N365S,C组的突变位点为N193S,S236T,A289V;D组的突变位点为Q90K,N193S,S236T,A289V。(2)使用纤维蛋白平板法测定菌株所产纤溶酶的活性,用BCA蛋白测定试剂盒测定发酵液的总蛋白含量,前者与后者的比值计算得到单位酶活。A组的单位酶活显著最高(p<0.05),平均为9.9IU/mg;B、C两组之间单位酶活平均值分别为3.39IU/mg和2.69IU/mg,两组之间无显著性差异(p>0.05),但B、C两组单位酶活显著小于A组(p<0.05);D组单位酶活平均值为0.19IU/mg,显著低于其他三组(p<0.05)。(3)选择单位酶活性最高的菌株,对其产生的纤溶酶QK进行纯化,得到可以用于晶体培养的高纯度纤溶酶QK。使用晶体筛选试剂盒,采用悬滴法进行晶体培养条件的筛选与优化,成功得到了高质量的片状蛋白晶体。晶体培养温度为16℃,蛋白浓度为15mg/m L,池液条件0.1M Bicine p H9.0,2%1,4-二氧六环,10%w/v聚乙二醇(PEG)20,000和0.2 M氟化钠(Na F),p H7.3,20%w/v PEG3,350。(4)将获得的晶体进行X射线衍射,得到分辨率为1.9?的衍射数据,使用HKL2000、CCP4、COOT、Phenix等软件进行数据处理和解析,得到了纤溶酶QK的晶体结构。晶体属于P1 211空间群,晶胞属于单斜晶系,晶胞参数键长a=74.1?,b=79.4?,c=87.4?,键角?=90.0°,?=111.5°,?=90.0°,完整性达到了99.6%。本研究探索了枯草杆菌纤溶酶QK的溶栓活性与氨基酸位点的相关性,找出了可能对单位酶活有影响的氨基酸位点。对最高单位酶活的枯草芽孢杆菌产生的纤溶酶进行纯化结晶,得到了高质量蛋白晶体并成功解析了晶体结构,这对研究纤溶酶QK的溶栓活性机制提供了理论基础。
其他文献
钢绞线拉索作为整个结构主要承载力其受力性能不容忽视,其受到破坏的情况时有发生,拉索的力学性能研究有待研究,其中环氧涂层钢绞线的应用范围包括新建工程及已有桥梁修复工程,其中单丝涂覆环氧涂层钢绞线拉索相比于普通钢绞线拉索而言具有良好的耐久性和耐腐蚀性。近年来,学者对于不同类型拉索和对不同构件的研究抗冲击性能都有一定量的研究,但对于单一构件单丝涂覆环氧涂层钢绞线拉索抗冲击性能的研究却很少。本文通过试验获
一、研究目的慢性肾脏病(Chronic Kidney Disease,CKD)发病率逐年增加,目前已成为全球所面临的重要公共卫生问题。了解肾小球滤过率(Glomerular Filtration Rate,GFR)变化情
背景:泌尿系结石简称尿石症,分布于肾、输尿管、膀胱、尿道任何部位,其中以上尿路结石较为常见,临床表现因结石部位不同存在差异性。尿石症病因复杂,常见因素包括:年龄、性别
目的:通过观察“以痛为腧”按压对大鼠的镇痛作用,探索推拿治疗臂丛神经损伤后神经病理性疼痛的作用机制,为推拿手法作用效应提供现代科学依据,并为臂丛神经损伤康复治疗提供新的思路。方法:将120只SD大鼠,随机分为空白对照组、假手术组、模型对照组、非阿是穴组、阿是穴组,各组24只。分别在造模前、造模后第3天、推拿治疗7天、推拿治疗14天、推拿治疗21天和推拿治疗28天进行冷痛阈、机械痛阈和条件性位置偏爱
目的:全球每年有约1810万癌症新发病例和约960万癌症死亡病例。肝癌发病率为4.7%,占各类癌症发病率的第六位;死亡率为8.2%,占各类癌症死亡率的第四位。在中国肝癌发病率占所有肿瘤中第四位、死亡率占第二位。在治疗方面,手术是肝癌治疗的首选,但肝癌手术患者存活率依然低。肝癌对目前其他治疗手段敏感性差,这成为肝癌致死率居高不下的重要原因。尽管,因此,分子层面的靶向治疗越来越引起人们的重视,但目前发
研究背景及目的终末期肾脏疾病的最佳治疗手段是肾脏移植,移植技术和手术方法的不断发展提高了肾移植的成功率,冷保存技术的改进也保证了移植肾存活率显著提高。但静态冷保存
研究背景和目的:高血压作为慢性心血管疾病,可以导致心脑肾等重要脏器损害,甚至功能衰竭,严重影响患者的预后。目前国内外相关指南推荐的降压目标值一般情况下均为130/80mmHg
近年来,全球范围内大停电事件的频繁发生对社会造成巨大的经济损失。提升大停电事件发生后配电网的故障恢复能力是提高国家风险防范能力、应急机制的重要举措,对于国家能源安全具有重要意义。大停电发生后,输电设施可能会遭到破坏,往往无法及时为配电网输送电能。但随着分布式电源的不断接入,综合利用分布式电源对配电网中失电负荷供电恢复,为配电网主动实现应急恢复提供了契机。然而,虽然充分利用风电、光伏等间歇性能源能够
随着现代战争中电磁环境日益复杂,波束形成技术被更加广泛地应用到电子设备空域抗干扰领域。而随着电磁环境更加复杂多样,天线阵列设备对自适应波束形成算法的要求也会更高。大型相控阵具有覆盖距离远、分辨率高、自由度高等优点,并且还可以实现多目标的同时跟踪,因而具有非常广泛的应用前景。但是,天线阵元数目越多,大型阵列对硬件的要求就会变得越高,因而如何将大型阵列付诸实践是一个亟待解决的问题。本论文针对上述问题,
目的:流行病学调查提示,孕期不良环境暴露的子代成年时期高胆固醇血症易感,并具有宫内起源。地塞米松作为一种人工合成的糖皮质激素,可治疗早产及相关妊娠疾病,因此广泛于产前使用。流行病学调查提示,产前地塞米松滥用将导致子代成年疾病易感,如肥胖、神经系统、骨关节炎和代谢综合征等。虽然已有动物研究发现,孕期地塞米松暴露(prenatal dexamethasone exposure,PDE)可致子代出生后血