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Mini-MFC组装机制的研究和eIF5-CTD晶体结构的研究多因子复合物(MFC)是43S前起始复合物形成过程中的一个重要的中间体,它由eIF1,eIF2,eIF3和eIF5四个蛋白质翻译起始因子包含十几个亚基组成的蛋白质复合物。MFC在真核生物蛋白质翻译起始过程中起重要作用,主要参与蛋白质重起始过程中三元复合物(TC)的招募和AUG起始密码子的正确识别。mini-MFC是MFC组装的最小核心部分,包含eIF1,eIF2Bβ-NTD,eIF3c-NTD和eIF5-CTD四个亚基,其中eIF5-CTD是最关键的亚基,它可以与其它三个亚基相互作用,从而介导mini-MFC的组装。
eIF5-CTD是真核生物蛋白质翻译起始因子5(eIF5)的C末端。eIF5是eIF2的一种特殊的GTP酶激活蛋白(GAP),在真核生物蛋白质翻译起始过程中,对前体起始复合物的组装和AUG起始密码子的正确识别起重要的作用。eIF5-CTD除了可以直接与eIF1,eIF2β-NTD,eIF3c-NTD结合形成mini-MFC外,还可以与eIF4G相互作用,在43S和48S复合物的组装过程中起核心作用。
本文先构建了mini-MFC的四个亚基,通过凝胶过滤层析法,荧光共振能量转移法和沉降速度法对四个亚基的相互作用做了研究,并尝试计算解离常数。通过凝胶过滤层析实验得知elF1与elF3c-NTD,elF2β-NTD与elF5-CTD,eIF3c-NTD与eIF5-CTD可以形成二元复合物;eIF1、eIF2β-NTD与eIF3c-NTD,eIF1、eIF3c-NTD与eIF5-CTD,eIF2β-NTD、eIF3c-NTD与eIF5-CTD可以形成三元复合物,eIF1、eIF2β-NTD、elF3c-NTD与elF5一CTD可以形成四元复合物。首先我们对单个亚基的晶体结构进行研究,得到了eIF5-CTD亚基的晶体并收到了1.5A的晶体数据。通过结构分析得知eIF5-CTD含有HEAT模式,与eIF2Bε-CTD和eIF4G-CTD的结构相似。通过对表面静电荷分布的分析和保守序列的分析确定了一些eIF5-CTD和其它eIFs的结合区域,这为理解mini-MFC的组装机制以及复合物的晶体结构分析提供了重要的信息。钩端螺旋体cbiC的晶体结构的研究cbiC是维生素B12生物合成途径中的一种异构酶,它可以催化甲基重新排列。维生素B12是自然界中结构最复杂的蛋白质辅助因子之一,在合成过程中需要多种蛋白酶辅助完成。在原核生物和动物(包括人类)中许多酶需要维生素B12做为辅酶因子,但仅有一些细菌和古菌能生物合成维生素B12。经过多年的研究发现维生素B12的生物合成主要通过厌氧和好氧两种途径。这两种途径的主要区别在于早期类似卟啉环的形成时Co<2+>的插入时间,最先需要Co<2+>插入的途径为厌氧途径,最后需要Co<2+>插入的途径为好氧途径。
本文中的cbiC是从问号状钩端螺旋体(一种致病细菌)的cDNA通过PCR克隆构建到:pET22b载体上的基因,经过Ni柱亲和层析纯化。纯化的蛋白质通过悬滴气相扩散的方法,得到了两种不同空间群的晶体分别是P42212(3.0A)和P3<,1>21(2.3 A)。通过序列分析得知它与cobH(维生素B12生物合成途径之一:好氧途径中的一种甲基变构酶)相似,因此通过分子置换得到cbiC的相位,并解出结构。通过与cobH晶体结构的对比分析可以推测cbiC与底物的结合位点。