本研究采用自然放牧条件下(多胸椎个体)乌珠穆沁羊,从扩增乌珠穆沁羊Myostatin (MSTN)基因全序列入手,对该品种MSTN基因的序列结构、核苷酸组成进行了分析,并对其编码蛋白质进行了预测分析,构建该基因分子进化树；同时分析了乌珠穆沁羊MSTN基因部分序列的多态性。结果显示：MSTN基因由3个外显子和2个内含子组成,其外显子大小分别为373bp、374bp、381bp,内含子大小分别为1833bp、2030bp。CDS序列全长为1128bp,由375个氨基酸组成。利用生物信息学软件分析发现：乌珠穆沁羊MSTN基因编码蛋白的理论分子量约为42.8kDa, PI值为7.01,Leu的含量最高(9.9%),其次是Lys(8.3%)。乌珠穆沁羊基因编码蛋白二级结构以随机卷曲结构为主,其蛋白属于跨膜蛋白,AA6-AA23之间为跨膜区,具有一个分泌信号肽结构。其氨基酸序列MQKLQICVYIYLFMLIVA具有TGF-β家族的特征。P6引物扩增的366bp的区域,在位于CDS序列第126bp处发生C→T的沉默突变,表现EE和EF两种基因型。引物P7扩增的353bp的区域,在所检测的范围内没有发现多态性。P8引物扩增的349bp的区域,在位于CDS序列第909bp处有一个A→G的沉默突变,表现AA和AB两种基因型。本研究为改善地方优良品种以及利用该基因开展乌珠穆沁羊分子育种技术研究等提供理论基础,并为建立乌珠穆沁羊基因文库提供可靠信息。