目前我国沿海水环境污染严重,尤其是浙江省大规模滩涂围垦造成滩涂湿地功能退化,沿海生态环境日益恶化。本文从水体的自净功能出发,说明水体溶解氧和底栖生物对于水质净化功能的重要性,分析浙江省容易发生水体缺氧、水质污染的机理。以景观生态学的结构功能理论、整体性与敏感性理论、景观异质性和边缘效应为理论指导,以碎片几何学中的分维数、形状指数和景观熵值作为量化指标,结合海洋动力学,采用多学科交叉的研究方法和多层次的分析手法,分析沿海景观地貌结构及其变化与滩涂底栖生物、水动力作用的吸氧等水质净化功能之间的关系；并以底栖生物多样性作为水质环境指标,根据国内外各十二大典型海湾底栖生物多样性和景观量化指标之间的相关分析和统计分析,建立水质环境和景观量化指标的综合关系式；以浙江省的钱塘江杭州湾、舟山群岛、三门湾、温州沿海地区为主要研究对象,对围垦前后沿海景观地貌特征进行定性与定量的比较分析,探讨滩涂围垦对水质环境影响的景观生态机理。最后从围垦工程的岸线形态、景观格局、边坡地貌形态设计三方面,结合发达国家生态围垦和生态修复的方法,以舟山群岛为例,应用景观量化控制指标探索有利于保持区域水环境的生态围垦模式,为我国的生态围垦提供科学依据。