我国作为萝卜的起源地之一,有着丰富的种质资源,了解这些资源的亲缘关系可以有效地指导育种工作。利用分子标记分析,可以快速、可靠地分析种质间的亲缘关系,在此基础上,还能构建种质资源的分子标记指纹图谱辅助开展品种保护工作。此外,随着生活水平的提高,人们对于蔬菜品质和外观的整齐一致也有了更高的要求,蔬菜种子的纯度越来越受到重视。传统育种方法生产的杂交种通常需试种一季,确保种子纯度合格后才能进行销售,既增加了繁种的工作量,又提高了种子贮存、管理等方面的成本。利用分子标记辅助技术进行杂交种纯度鉴定只需在苗期采集叶片,提取DNA进行检测,大大缩减了成本和周期。然而,目前在萝卜中利用分子标记构建指纹图谱和鉴定杂交种纯度的研究还相对较少。为此,本研究利用118个标记,对110份萝卜种质资源进行了分析,通过筛选标记,分析了110份材料的亲缘关系,并构建了种质的指纹图谱。从118对引物中筛选出2对引物对杂交种‘圣萝翠玉’进行纯度鉴定;为杂交种‘圣萝艳玉’筛选出4对引物进行杂交种纯度鉴定,并进行了验证。取得的研究结果如下:1.以110份国内外部分优异萝卜种质为材料,从118对引物中筛选出56对多态性高、带型清晰的引物,在110份材料中共扩增出130条谱带,平均2.3条,多态性比率为100%,多态信息量(PIC)变化范围为0.30-0.55,中度多态性引物包括53对,高度多态性引物为3对。利用这筛选的标记进行遗传多样性分析,110份材料的遗传距离的变化范围在0.54-0.99之间,在聚类阀值在0.54处,将110份萝卜种质分为两个类别;在聚类阀值0.66处,可将110份材料分为11个类别,包括2个大类和9个小类。2.从56对多态性高,带型清晰的引物中筛选出18对核心引物能够区分开110份萝卜种质,其中有3对引物RsSSR108、RsIBP18和RsSSR109能单独区分开4份种质,17对引物组合可以区分106份种质,构建了110份萝卜种质的指纹身份编码。3.通过杂交种纯度鉴定的研究,筛选出2对引物应用于杂交种‘圣萝翠玉’的纯度鉴定以及为杂交种‘圣萝艳玉’筛选出的4对引物进行纯度鉴定。研究结果显示,筛选的引物均能扩增出与其父母本呈共显性关系好的条带,且引物扩增带型与田间杂交材料的表型相一致。