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生肌调节因子（myogenic regulatory factors，MRFs）称为MyoD家族，具有一个保守的碱性螺旋-环-螺旋结构（bHLH），包括MyoD（MyoD1，Myf-3）、MyoG（Myogenin）、Myf-5和MRF-4（Myf-6）四种调节因子。本文分离了吉富罗非鱼[Genetic Improvement of Farmed Tilapias（Oreochromis niloticus），GIFT]MyoD1、MyoD2和MyoG的cDNA序列。MyoD1 cDNA全长为1090 bp，阅读框903 bp，编码300个氨基酸；MyoD2 cDNA全长为1478 bp，阅读框792 bp，编码263个氨基酸；MyoG cDNA全长为1599 bp，阅读框753 bp，编码250个氨基酸。氨基酸同源性分析表明，吉富罗非鱼MyoD1与其他鱼类MyoD1的相似性为73％-92％，与鱼类MyoD2的相似性为62％-65％，与哺乳动物MyoD的相似性为63％-64％；MyoD2与其他鱼类MyoD2的相似性为74％-79％，与鱼类MyoD1的相似性为59％-62％，与哺乳动物MyoD的相似性为58％-59％；MyoG与其他鱼类MyoG的相似性为73％-95％，与哺乳动物MyoG的相似性为57％-59％。系统发育树显示，MyoD1、MyoD2和MyoG分属三支，MyoD1和MyoG所反映不同鱼类之间的亲缘关系基本符合传统的分类，而MyoD2至今只在部分鱼类（刺鳍总目）中发现。以β-actin为内标的荧光实时定量RT-PCR结果显示，MyoD1、MyoD2和MyoG在肌肉中高表达，在脑、心脏，肝脏、肾脏和性腺等组织微量表达，为进一步研究MyoD家族的功能奠定基础。
分离了吉富罗非鱼MyoD1、MyoD2和MyoG的内含子序列，并分析了奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼之间内含子上的差异，奥利亚罗非鱼MyoD1的2个内含子和MyoG的内含子1均比尼罗罗非鱼长，差异明显，相比之下MyoD2的2个内含子和MyoG的内含子2差异不明显。根据MyoD1内含子2的差异建立了鉴别奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼基因混杂的标记，为选择基因纯合的奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼提供了分子手段。
运用直接测序法对吉富罗非鱼MyoD1、MyoD2和MyoG的SNPs（SingleNucleotide Polymorphisms）位点进行筛选，共获得MyoD17个SNPs位点，其中1个位于外显子1，其余均在内含子上；MyoD2外显子1有个1个SNPs位点；MyoG中未找到SNPs位点.构建PCR-RFLP法检测MyoD1外显子1 A324G和内含子1 T471C在192尾吉富罗非鱼中的基因型，并分析了不同基因型与生长性状的相关性。外显子1 A324G转换导致AccⅡ酶切位点的改变，使用PCR-RFLP法检测该位点的基因型，结果显示整个实验群体不存在GG型，AG和AA的基因型频率在雌鱼中分别为0.19和0.81，在雄鱼中分别为0.24和0.76；与生长性状的相关性分析表明，各基因型在体型、增重方面都无显著差异（P>0.05）。内含子1 T471C转换导致 AluⅠ酶切位点的改变，使用使用PCR-RFLP法检测该位点的基因型，结果显示，CC、CT、TT基因型频率在雌鱼中分别为0.08、0.38、0.54，在雄鱼中分别为0.07、0.30、0.63；与生长性状的相关性分析表明，各基因型在体型、增重方面都无显著差异（p>0.05）.本文所筛选的吉富罗非鱼MyoD12个SNPs位点在进一步的家系选育过程中，与生长性状的相关性分析以及其他SNPs位点的检测需进一步研究。