宁夏杂草稻的遗传多样性及亲缘关系研究

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水稻是主要的经济作物,世界上近一半以上人口以此为主食。然而近年来,随着直播稻田种植面积的不断扩大,杂草稻的危害逐年加重,严重威胁着水稻生产。目前宁夏杂草稻的来源、传播、遗传特性还没有进行系统性的研究与分析,多数凭借经验来判断和鉴定,为准确鉴定和防治带来一定的难度。虽然杂草稻是危害水稻产量和品质的问题杂草,但也有其可利用的一面。因此,积极收集杂草稻资源,深入研究其遗传特性、生存习性等,探讨杂草稻的来源与传播规律,对今后杂草稻的防治、鉴定、利用等有重要意义。本研究对宁夏杂草稻的表型性状进行分析,并分别与宁夏现代栽培品种、宁夏地方品种进行比较分析。利用SSR标记,研究宁夏杂草稻与当地水稻种质的遗传多样性和亲缘关系,以及不同地理来源杂草稻、选育品种、地方品种、野生稻的遗传差异和亲缘关系。获得的结果如下:(1)对宁夏杂草稻、选育品种、地方品种的表型性状调查发现,杂草稻的平均多样性指数(1.95)高于地方品种(1.75),但略低于选育品种(1.98)。在杂草稻群体内,8个组群的杂草稻平均多样性指数大部分相差不大。SSR遗传分析发现,杂草稻的Nei’s基因多样性指数为0.4402,略小于选育品种(0.4647),但两者没有显著差异;地方品种的Nei’s基因多样性指数为0.2827,显著低于杂草稻和选育品种。杂草稻组群间的遗传多样性指数差异大多数都不显著。说明宁夏杂草稻与选育品种的遗传多样性相似,这与宁夏稻区生态类型单一及杂草稻的演化有关,且杂草稻没有明显的区域分化现象。(2)对宁夏杂草稻、选育品种、地方品种进行聚类分析,表型数据聚类发现杂草稻、选育品种、地方品种分为2类,第Ⅰ类由选育品种组成,第Ⅱ类包括8组杂草稻和地方品种。SSR数据聚类发现,选育品种聚为第Ⅰ类群,而杂草稻和地方品种混合聚为第Ⅱ类群和第Ⅲ类群。宁夏杂草稻各群体之间没有明显的界限,分布均匀,说明宁夏杂草稻的分布无明显的区域性。且宁夏杂草稻与地方品种之间也呈较均匀分布状,杂草稻材料与地方品种材料之间高度融合。可见,宁夏杂草稻与地方品种的亲缘关系更近,其来源与地方品种有关。(3)对宁夏及来自国内外5个地区的杂草稻群体的Nei’s基因多样性指数进行分析,比较发现,5个地区杂草稻群体的Nei’s基因多样性指数大小顺序为吉林杂草稻(0.5133)、宁夏杂草稻(0.5022)、黑龙江杂草稻(0.4667)、韩国杂草稻(0.3767)、辽宁杂草稻(0.3366),不同地区的杂草稻的遗传多样性之间有差异;杂草稻的遗传多样性相对低于野生稻。(4)不同地理来源水稻种质的聚类结果发现,杂草稻与当地地方品种的亲缘关系更近,而与当地选育品种和野生稻的亲缘关系较远。宁夏杂草稻、黑龙江杂草稻、吉林杂草稻、辽宁杂草稻与粳稻的亲缘关系较近,而韩国杂草稻与陕西籼稻的亲缘关系较近,可见杂草稻类型多样,具有籼粳分化。在本研究中大多数杂草稻很可能是由当地的地方品种形成或起源的,而由籼粳栽培稻杂交、栽培稻与野生稻杂交、或直接由野生稻形成的可能性较小。不同地区的杂草稻之间存在一定差异,具有一定的地域性,且杂草稻的类型多样,分化较多,发生相对独立,其可能是分散起源的。
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