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背景:慢性咽炎（Chronic Pharyngitis）为耳鼻喉科门诊常见多发病,全球约超过20%的成年人患有此病,而且患病率逐年增加。慢性咽炎临床上分为慢性单纯性咽炎、慢性肥厚性咽炎及变应性咽炎,前两种和细菌感染相关。与急性咽炎主要致病菌为A组乙型溶血性链球菌有所不同,慢性咽炎感染与细菌的关系及相关机制尚无统一定论,临床上对其治疗存在抗生素泛用现象,容易导致细菌耐药性的增加和微环境破环,加重病情。二代测序技术的应用加深了我们对于菌群的认识。近期研究提示咽喉部菌群紊乱可能与咽炎的发生相关。但是咽炎病人咽部菌群结构整体变化尚未有研究报道。目的:解析正常人、慢性单纯性咽炎、慢性肥厚性咽炎的菌群组成结构的差异,寻找在咽炎发生发展进程中,门科属水平上出现变化的特异性菌群,探索菌群变化与慢性咽炎发生发展的关系,为慢性咽炎的治疗打开新思路。方法:1.选取符合临床诊断标准、排除菌群干扰因素（抗生素、中成药治疗等）的慢性单纯性咽炎病人15例与慢性肥厚性咽炎病人20例。选取年龄、BMI、男女比例与之相匹配的正常人18例。2.采集咽后壁分泌物,提取分泌物DNA,PCR扩增后进行16S rDNA测序,用生物信息学比较分析正常人与慢性单纯性咽炎（S）、慢性肥厚性咽炎（H）咽部菌群多样性,菌群门科属水平的差异。结果:1.与正常人相比,慢性单纯性咽炎病人和慢性肥厚性咽炎病人的咽部菌群多样性变化不大。2.在门水平上,测序及分析结果显示正常人口腔菌群优势菌门主要为Proteobacteria（变形菌门）、Firmicutes（厚壁菌门）、Actinobacteria（放线菌门）、Fusobacteria（梭杆菌门）、Bacteroidetes（拟杆菌门）五大门。在正常人、慢性单纯性咽炎、慢性肥厚性咽炎三组间SaccharibacteriaTM7菌门比例渐进性下降;Synergistetes（互养菌门）呈下降趋势,Actinobacteria（放线菌门）呈上升趋势。3.在科水平上,Metastats结果显示,在正常人、慢性单纯性咽炎病人、慢性肥厚性咽炎病人三组间咽部菌科比例呈现出渐进性上升的Brucellaceae（布鲁氏杆菌科）、Paenibacillaceae（类芽孢杆菌科）、Mycobacteriaceae（分枝杆菌科）,呈现渐进性下降的菌科有Pasteurellaceae（巴斯德氏菌科）、Aerococcaceae（气球菌科）、Peptococcaceae（消化球菌科）、Dethiosulfovibrionaceae（脱硫硫杆科）、TM7[F-1]。另外,在正常人、慢性单纯性咽炎病人、慢性肥厚性咽炎病人三组间咽部Neisseriaceae（奈瑟氏菌科）丰度比例呈下降趋势。4.在属水平上,Metastats分析结果显示,在正常人、慢性单纯性咽炎病人、慢性肥厚性咽炎病人三组间咽部菌属比例呈现出渐进性上升的有Ochrobactrum（苍白杆菌属）、Lysinibacillus（赖氨酸芽孢杆菌属）、Paenibacillus（类芽孢杆菌属）、Alloscardovia（异斯卡多维亚菌属）、Mycobacterium（分枝杆菌属）、Chlamydophila（衣原体属）。呈现出渐进性下降的有Haemophilus（嗜血杆菌属）、Lautropia（劳特罗普氏菌属）、Abiotrophia（营养缺陷菌属）、Peptococcus（消化球菌属）、Granulicatella（颗粒链球菌属）、Pyramidobacter（锥形杆菌属）、TM7[G‐1]、TM7[G‐3]。另外,在正常人、慢性单纯性咽炎病人、慢性肥厚性咽炎病人三组间咽部Neisseria（奈瑟氏菌属）比例呈下降趋势。结论:1.与正常人相比,慢性单纯性咽炎病人和慢性肥厚性咽炎病人的咽部菌群多样性无明显变化。2.与正常人相比,慢性单纯性咽炎病人和慢性肥厚性咽炎病人咽部菌群在门科属水平出现了差异,发生菌群紊乱。3.慢性咽炎菌群紊乱以衣原体属、苍白杆菌属、赖氨酸芽孢杆菌属、类芽孢杆菌属、分枝杆菌属增高,营养缺陷菌属、消化球菌属、颗粒链球菌属、锥形杆菌属、TM7[G‐1]、TM7[G‐3]降低为特征。菌群紊乱可能与咽炎的严重程度相关。