目前关于越冬蓝藻的理论研究主要是蓝藻的越冬对于次年水体蓝藻生物量的贡献，着重研究蓝藻的垂直迁移以及复苏对于次年夏季蓝藻水华构成的影响，一般都是基于深水湖泊蓝藻越冬复苏的研究，只有很少的研究是浅水湖泊。针对我国广泛分布的大型浅水湖泊，研究水华的发生过程，不仅仅要了解其复苏和形成水华的过程，更要提前知道，蓝藻是在哪个湖区的底泥表面越冬，以及来年春季最有可能在哪个湖区最先复苏，形成最早的蓝藻水华，以便采取具有针对性的措施，去除越冬蓝藻，尽可能控制夏季蓝藻水华的强度。了解了冬季蓝藻的时空分布特征，对于次年蓝藻水华控制和预测预警有着重要的意义。太湖作为一个浅水湖泊，有着强烈水体扰动，使得蓝藻的越冬分布更为复杂。为确定2007—2008年冬季蓝藻在太湖各个湖区的分布及其变化规律，逐月对太湖主要湖区14个位点采集底泥和水样，应用荧光分析法测定样品中藻蓝素和叶绿素含量，并结合气象和水文理化参数分析，确定冬季太湖的蓝藻分布状况和蓝藻越冬地分布区域的影响因素，比较冬季太湖水体和底泥中蓝藻的分布差异，初步确定了太湖越冬蓝藻的时空分布特征，从而为寻找蓝藻越冬时空分布与来年水华发生过程的生态格局联系提供背景数据。研究结果表明：　　 2007年越冬期间，太湖蓝藻分布主要位于西太湖和中南太湖的部分区域，可以认为这些水域是2007年至2008年蓝藻越冬的主要区域。次年复苏阶段，各个湖区底泥和水体蓝藻增长时间基本相同，但是冬季底泥蓝藻浓度较高的西南太湖和湖心增长速度要高于北部太湖。　　 参照调查期间1月的气候条件变化和1月降雪前后蓝藻水华的差异，表明极端气候可能是冬季太湖水体蓝藻群体迅速消失的主因。　　 表层底泥TN，TP与底泥中叶绿素a具有显著正相关(p＜0.01)，因而沉积物中TN，TP的地区差异和时间变化也体现了藻类分布区域在全湖范围内的变化。而中南湖区底泥中TN，TP在08年1月至08年3月的迅速增长，也表明中南湖区在越冬过程是总浮游植物聚集的区域，而整个越冬周期中，蓝藻占总浮游植物的比例一直高于50％，因而中南太湖是越冬蓝藻重要的聚集区，也是蓝藻复苏主要所在地。　　 风场变化是越冬蓝藻区域分布变化的主要驱动因子之一。太湖盛行风场的转变使得冬季蓝藻向西南和湖心区域集中并在这些湖区越冬。而次年春季蓝藻复苏的快慢与越冬地存在显著相关性，使得风场变化成为次年蓝藻复苏最早区域分布的主导因素之一。