肺腺癌基因变异分析及p53、KRAS的表达与意义

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背景:肺癌是发病率和病死率均最高的癌症之一。肺癌的发生与多种因素相关。肺癌确诊患者中以肺腺癌最为常见。研究发现,肺腺癌发生发展与基因改变的遗传多样性和易感性关系密切,因此研究肺腺癌突变基因变异对于肺腺癌的临床诊疗具有重要意义。目的:检测并分析肺腺癌基因变异,明确肺腺癌常见基因突变种类及分布,探讨常见基因突变在肺腺癌中的表达及其意义。以二代测序结果为金标准,比较IHC、ARMS-PCR方法在检测肺腺癌基因突变上的可靠性。方法:1)采用二代测序技术检测29例肺腺癌石蜡样本中26个常见肿瘤相关热点基因;分析高突变率基因表达与肺腺癌临床病理特征的关系;分析基因共表达相关性。2)从29例肺腺癌样本中随机选出18例采用检测EGFR突变,并与二代测序结果比较;剩下11例采用ARMS-PCR方法检测EGFR突变,并与二代测序结果比较;3)采用IHC检测29例肺腺癌样本中p53与KRAS的突变,并与二代测序结果比较4)扩充29例肺腺癌样本至99例,采用IHC检测p53蛋白和KRAS蛋白的表达,分析两者表达与肺腺癌临床病理特征的关系,分析p53与KRAS在肺腺癌组织中表达的相关性。结果:1)26个被检基因中发现6个基因发生突变,分别是EGFR(21/29)、p53(12/29)、KRAS(3/29)、ROS1(3/29)、ALK(1/29)和RET(1/29)。2)EGFR突变多发生在19号(9/21例)和21号(10/21例)外显子上,2例发生在20号外显子上(其中1例在20和21号外显子上均有突变),1例发生在18号外显子上。p53突变位于6号(4/12)、4号(2/12)、5号(2/12)、8号(2/12)、7号(1/12)和10号(1/12)外显子上;KRAS突变均发生在2号(3/3)外显子上。3)29例中14例存在共突变,其中1例发生3种基因共突变(EGFR、KRAS、ROS1),13例发生双基因突变(10例EGFR和p53,1例EGFR和KRAS、1例EGFR和ROS1,1例p53和KRAS),12例发生单基因突变,3例未检出基因突变。4)29例肺腺癌样本中,EGFR、p53、KRAS、ROS1这四个基因未表现出与患者临床病理特征(包括年龄、性别、肿瘤直径、淋巴结转移、病理亚型)之间的相关性,且任意两个基因在肺腺癌组织中的表达之间未表现出相关性。这可能与样本量较小有关。5)在EGFR突变检测上,ARMS-PCR方法表现出与二代测序良好的一致性,而IHC方法则出现了假阳性与假阴性的结果,与二代测序一致性较差。6)在p53与KRAS突变检测上,IHC与二代测序结果一致性较好7)99例肺腺癌组织样本免疫组化检测结果显示:肺腺癌组织中p53阳性率为30.3%,KRAS阳性率为23.2%,两者表达无明显相关(r=0.054,P=0.594)。8)99例肺腺癌组织样本中,p53表达与患者性别、年龄、病理亚型、肿瘤大小、有无淋巴结转移、TNM分期和分化程度均无关(P>0.05),KRAS表达也与患者年龄、病理亚型、肿瘤大小、有无淋巴结转移、TNM分期和分化程度无关(P>0.05),但KRAS在男性(36.4%)肺腺癌中的表达高于女性(12.7%)(P<0.05)。结论:肺腺癌组织中存在多种基因突变,并可发现共突变,EGFR突变多在19和21号外显子上,p53突变多集中在6、4、5和8号外显子上,KRAS突变多在2号外显子上,且KRAS突变更多见于男性患者。IHC检测EGFR突变可靠性可能不及ARMS-PCR法和二代测序方法。
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