伴随着现代公司制企业的发展和规模的扩大，企业的利益相关者越来越多，这些利益相关者不可能同时直接参与企业的日常经营活动，所以，代理行为应运而生。　　在企业中，由管理层支持公司的运转，企业的所有者——股东并不直接参与经营活动，因此管理层有机会利用信息和经营权等优势侵占股东的利益，这种由于管理层与股东之间的利益冲突产生的代理成本被称为第一类代理成本。不仅管理层与股东之间会发生利益冲突，同样是企业所有者的股东之间也可能产生利益冲突。国内的大多数企业股权高度集中，少数股东持有公司绝大多数股份，拥有公司的绝对控制权，这意味着他们可以左右公司整体的政策、决策等，做出有利于自己的经营决策，而忽略大多数中小股东的利益。这种大股东侵占中小股东利益产生的代理成本称为第二类代理成本。第一类代理成本和第二类代理成本就是我们通常所说的股权代理成本。债务融资是企业重要的资金来源，因此债权人是企业的重要利益相关者之一。股东为了获取高额利润，可能会将债务资金投资于高风险项目，或者违背约定条款，不断发行新债，这可能导致债权人的本金利息无法收回，将严重威胁债权人的利益。这种股东和债权人之间的代理成本本文称之为第三类代理成本。代理问题处理不恰当在危害企业本身的生存与发展的同时也损害了股东、债权人等利益相关者的利益。因此，企业应当对代理问题引起足够的重视，如何降低各类代理成本应是企业需要着重解决的问题。　　本文认为，对公司的治理实质上是对人的治理，降低代理成本应当恩威并施，从激励机制和约束机制两方面下手，既要有行之有效的激励措施，也要提高内部控制质量。本文的研究内容分为以下几个部分:　　第一部分，绪论。本部分首先介绍了本文的研究背景和研究意义。其次，从内部控制、激励机制和代理成本三个方面梳理了国内外的相关文献，并且对文献进行了评述。这便于了解国内外的研究现状，吸收已有的研究成果，找出前人研究的不足之处。最后，介绍了本文的研究内容、研究方法和技术路线，并点出了可能存在的创新和不足之处。　　第二部分，内部控制、激励机制与代理成本的相关理论分析。本部分首先对内部控制、激励机制和代理成本进行了概念界定，然后从不同的理论层面阐述代理问题产生的根源，阐述内部控制和激励机制的有效性和作用机理。这部分为后面的实证研究奠定了理论基础。　　第三部分，研究设计。在前一部分理论分析的基础上，本部分提出了研究假设，并说明了样本选择与数据来源，分别对被解释变量、解释变量和控制变量进行了详细的解释。本文针对激励机制与内部控制质量的关系提出了假设一，针对激励机制与代理成本的关系提出了假设二，针对内部控制质量与代理成本的关系提出了假设三。实证研究以2011年到2013年中小板上市公司的数据为样本。最后，再此基础上，本文根据不同的假设和变量设计了实证研究的模型。　　第四部分，实证检验及分析。本部分首先对所有的变量做了描述性统计分析，以便对数据做出初步的观察和分析，了解变量数据的特点;接下来对数据进行了相关性检验，检查各变量之间是否存在多重共线性;最后进行多元回归分析，以检验提出的假设是否成立。　　第五部分，研究结论、建议与展望。本部分在实证研究的基础上进行分析解释，得出本文结论;然后把结论与企业的实际情况相结合给出建议，并对后续的研究方向进行了展望。