基于分子模拟技术的抗CD47抗体结构预测与人源化改造

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qingyun2008520
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背景与目的:CD47表达于多种肿瘤细胞表面,可与信号调节蛋白SIRPα相互作用,降低机体巨噬细胞的吞噬能力,从而介导肿瘤细胞的免疫逃逸。研究发现,在许多预后较差的癌症肿瘤细胞中都存在着CD47的大量表达,因此研制抗CD47抗体对肿瘤靶向治疗具有重要的临床意义,也具备广大的应用前景。我们实验室在前期通过单克隆抗体筛选获得了两株亲和力、特异性较好的抗CD47抗体,为了深入研究其性质,我们使用计算机对其进行三维结构的同源建模、分子动力学模拟与抗原分子对接,以探究其结构优化与人源化改造的可能性。方法:使用Discovery Studio软件对抗CD47抗体进行同源建模,对其结构合理性进行评估与分析;使用GROMACS进行分子动力学模拟,深入分析抗体结构的稳定性以及CDR区中柔性较高的氨基酸区域;最后将抗体与抗原分子进行分子对接,分析结合的抗原表位及氨基酸残基理化性质,作为与其他抗CD47抗体比较及人源化改造的依据,为下一步的抗体结构优化提供参考。结果:成功构建了抗CD47抗体2C8与3A3的三维结构,通过分子动力学模拟与分子对接技术预测了抗体的一系列理化性质与结合表位,并在此基础上设计了初步的人源化改造方案,为下一步实验提供了有力的数据支持。结论:本课题通过分子模拟技术,成功分析了抗CD47抗体2C8与3A3的理化性质与抗原结合表位,并基于表面重塑技术对其进行了人源化改造,为进一步完善抗体人源化及抗体亲和力奠定了理论基础。
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