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目的:探讨贵州遵义地区蝙蝠体内是否存在博尔纳病病毒(BDV)的自然感染,将贵州遵义地区蝙蝠感染的BDV p40核苷酸序列与国外标准株、流行株进行同源性分析,进一步丰富贵州地区BDV流行病学特征。方法:采用实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(Fluorescence quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction,FQ-RT-PCR)对82例蝙蝠额颞叶脑组织中BDV p40基因片段进行检测,阳性产物进行纯化、克隆和核苷酸序列测定,并与国外标准株、流行株比对,分析其同源性及变异;同时采用免疫印迹法(Western blotting,WB)检测蝙蝠脑组织中博尔纳病病毒核蛋白(Nucleoprotein,N)。结果:贵州遵义地区82例蝙蝠额颞叶脑组织中,BDV p40基因片段的检出率是12.2%(10/82),通过美国国家生物技术信息中心(NCBI)比对、分析阳性产物的核苷酸序列,贵州遵义地区蝙蝠脑组织中的BDV p40核苷酸序列与标准株Strain V和流行株H1766比对同源性均为96.2%,有3个碱基发生突变(nt548G>T,nt550T>G,nt553A>T),突变率为3.8%(3/78),与流行株He/80进行同源性分析时,发现有4个核苷酸发生突变(nt548G>T,nt550T>G,nt553A>T,nt609T>C),突变率为5.1%(4/78),但所编码的氨基酸并没有变化;蝙蝠额颞叶脑组织中博尔纳病病毒核蛋白阳性率为12.2%(10/82);其中有6例蝙蝠脑组织同时检出BDV p40基因片段及核蛋白。结论:贵州遵义地区的野生蝙蝠存在博尔纳病病毒的自然感染;该地区野生蝙蝠所感染的BDV p40基因片段与标准株Strain V、流行株H1766的核苷酸序列具有高度同源性,该地区可能是BDV的流行区域之一。