近些年来我国一直保有较高的经济增长速度,然而,这是一种对投资驱动和资源耗费过度依赖的“粗放型”增长。这种增长方式势必会带来环境污染、能源匮乏等诸多问题,而这些问题将会逐渐成为我国经济增长的瓶颈,因此,如何转变我国的经济增长方式尤为重要。在这一转换过程中,科学技术发挥着不可替代的作用,我国作为一个发展中国家,科技水平尤其是自主创新能力在国际上仍位于较低水平,所以,增强研发能力、提高科技水平对促进我国经济发展、提高我国科技竞争力具有重要意义。研发投入的产出效率不高、区域创新水平过于悬殊、研发成果到产品的转化时滞过长等问题,都很可能制约中国经济的发展,影响中国在国际化背景下的地位。因此,研发活动如何更有效率的进行、研发投入的组成部分之间如何更好的协调、各个区域之间如何创新溢出、资源共享等,在这个依靠技术进步的今天就显得非常重要。鉴于科学技术有着不可替代的优越性,科技创新水平逐渐成为衡量一个国家综合实力的集中体现,国家之间的竞争愈来愈表现为各个国家科技能力的竞争。研发投入是科技创新活动的主要投入因素,是科技进步的能源,研发水平直接决定着一个国家的科技创新水平。因此,随着研发活动逐渐成为各个国家关注的焦点,诸如研发投入的效率和效果、研发产出水平和区域研发活动的协调发展等问题也已成为国内外学者的研究重点。本文首先在回顾国内外研究文献的基础上,结合我国研发活动中各个相关量现状的对比分析,并针对目前在研发投入产出研究领域内的研究内容和方法上存在的空白或不足,引入面板向量自回归(PVAR)模型和空间面板数据模型(SPDM)来分析我国研发投入产出关系问题。本文以我国研发经费和研发人员全时当量作为研发投入因素,用专利申请数来衡量区域研发产出水平,对我国30个省市(西藏除外)1998-2010年的面板数据进行实证分析。其中把经费投入分为三部分,分别是科研机构、大中型工业企业和高校的经费投入,以此来衡量各部门的研发效率以及部门之间的相互关系。面板向量自回归模型分析把所有变量都视同内生变量,不区分自变量和因变量,通过该方法可以得到研发投入和产出的5个变量之间的短期和长期影响。空间面板数据模型分析可以探讨研发活动的投入和产出变量在空间范围内是否存在空间联系以及这种联系的方向和大小如何。通过两种实证分析方法,本文得到如下结论：第一,目前除了张瑞、苏方林和李臣(2011)对我国研发活动的研究以外,PVAR方法还没有应用于我国研发投入和产出关系的研究上。本文通过建立PVAR模型,使用方差分解和脉冲响应函数分析方法,可以得到如下实证结果：三部门研发经费投入对研发产出都有影响,相比科研机构和高校研发经费投入的产出效应而言,企业研发经费投入对产出的贡献率最大；企业研发经费投入和高校、科研机构的经费投入之间存在相互影响。研发人员的产出贡献率在短期内并没有通过显著性检验,在长期中研发人员对专利申请数的方差贡献度很大。前期专利申请数与当期专利申请数有同向作用,研发三主体的前期经费投入对当期投入也有同向作用。研发人员投入和经费投入之间也存在一定影响。由以上实证结果可知,政府的经费投入和人力投入的产出效应并不相同,三部门经费投入的产出弹性也相差很大,研发投入各因素和产出之间存在错综复杂的同期或滞后的前向或后向关系,因此,政府的研发决策要具有针对性、灵活性和期限性。第二,利用空间计量经济学的空间滞后模型、空间误差模型和空间杜宾模型,从另一角度比较了科研机构、大中型工业企业和高校的经费投入以及研发人员投入在空间上的产出弹性,并着重分析了各要素之间的空间溢出效应。结果表明：在考虑空间因素的情况下,科研机构和高校经费投入对专利产出的贡献不大,企业经费投入的产出弹性较大；研发人员也对专利产出产生了显著的积极作用；邻接地区的专利产出对本地区的专利产出存在正的溢出效应,邻接地区的三部门经费投入对本地区的研发产出都有空间效应,但研发人员投入对专利产出的空间效应并不显著。结合空间效应分析的结果,我们不难发现,各个省域的研发活动并不是完全孤立的,政府应该充分重视省域之间研发活动存在的空间效应,协调区域间的研发活动发展。