在总结自然垄断、自然垄断效率、自然垄断产业效率相关理论基础上，分析了现代自然垄断产业存在的效率冲突，剖析了国有化、规制、有效竞争模式存在的缺陷，进而借鉴产业组织理论哈佛学派、芝加哥学派观点和波特竞争学说，提出了实现自然垄断产业效率的有效市场模式，建立了自然垄断产业有效市场的模糊综合评价体系。在此基础上，较为详细地阐述了转型经济条件下我国自然垄断产业有效市场的特点和实现路径，探讨了改善国有企业效率和有效推进普遍服务的方式，并运用自然垄断产业有效市场模型，实证分析了电力产业、电信产业的市场效率状况。研究提出，自然垄断产业效率是自然垄断效率与竞争效率的有机结合，以有效竞争为基础，构建有效市场结构、有效市场行为、有效市场绩效，实现竞争与规模兼容、竞争与规制兼容、竞争与垄断兼容、国有与民营兼容、效率与公平兼容，是实现自然垄断产业效率的必然取向，而转型经济则决定了我国自然垄断产业有效市场形成具有渐进性变迁特点。