工业革命以来，由于经济与环境的不均衡发展，产生了大量的二氧化碳，严重影响了生态平衡。上世纪90年代以来，国际社会一直致力于遏制环境的恶化，低碳经济便在这种背景下应运而生。我国是制造大国，制造业占我国GDP的50%以上，但是，目前我国的制造业还处于高能耗的低端制造阶段。因此，为了保证我国制造业能够及时顺应快速变化的市场环境和实现低碳经济下的减排承诺，本文提出供应链上下游企业在减排研发阶段进行合作。通过共享技术信息和资源，分摊研发费用等，来应对这一挑战。围绕低碳经济下制造商在减排研发阶段的合作问题，本文主要分为四部分：第一部分包括第一章和第二章，是全文研究的出发点和理论基础。第一章从目前的国际减排大环境出发，分析了我国发展低碳经济的必然性和我国制造业面对的严峻形势，进而提出减排合作研发是企业实现转变的有效途径之一。然后阐明了本文的研究方法、主要内容以及技术路线。第二章主要介绍了本文研究的理论基础。第二部分（第三章）讨论了低碳经济的三维交易模式。研究了基于碳排放权交易和政府分配初始碳配额的碳排放权交易机制，然后，提出了基于该机制的制造商三维（资源、产品和碳排放权）交易模式，从经济效益和社会效益（福利）出发建立了基于三维交易模式的制造商利润最大化模型。第三部分（第四章）探讨了制造商单独进行减排研发和上下游制造商进行合作减排研发两种情况。首先，运用数值分析的方法分别分析了政府分配h、减排的成本系数t以及碳交易的价格k对制造商和供应商最优产量、减排量（只有供应商）和利润的影响；然后，比较了合作前后制造商的最优产量、单位产品的减排量以及制造商和供应商各自的利润增加量，并得出制造商与供应商进行研发减排合作的前提条件。第四部分（第五章）对全文进行总结和展望。本文的创新点表现在以下几个方面：（1）明确提出低碳供应链的三维交易模式，并建立该三维模式下的制造商利润最大化模型。（2）将低碳经济、企业减排与纵向合作研发相结合，从供应链的视角出发，探讨低碳经济下制造商的合作机制。