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植物和根际微生物之间是一种复杂的相互关系。芽胞杆菌(Bacillussubtilis)和丛枝菌根真菌(Arbuscular Mycorrhizal Fungi，AMF)是两类重要的根际微生物，两者的相互作用对于根际群落的稳定、土壤污染修复以及根际病害的生物防治都具有重要意义。本文选用了两株分别具有产生生物表面活性剂和抗菌肽的能力的根际枯草芽孢杆菌，研究了它们与AMF的相互作用，并探讨了此类菌株在环境修复和农业生防等方面的应用潜力。
1.研究了生物表面活性剂surfactin及其产生菌Bacillus subtilis BS1，对丛枝菌根真菌发育的影响。结果显示，B. subtilis BS1无论在体外还是土壤坏境下都能够促进AMF的孢子萌发和菌丝生长。特别在体外条件下，对Glomusetunicatum萌发菌丝的生长具有强烈的刺激作用。通过双隔培养研究，发现BS1对AMF的刺激效应并不是由气体产物所作用的，而主要是由其所分泌的水溶性物质所诱导。另外，B.subtilis BS1能够在土壤条件下诱导G. etunicatum形成共生前孢子(presymbiotic spores)。但是，在B.subtilis BS1所产生的surfactin体外试验中，当surfactin的浓度超过成束胶团浓度(Critical Micelle Concentration，CMC)时，surfactin能够显著影响AMF G. etunicatum和G. intraradices的发育。但是在土壤条件下，surfactin对AMF的抑制作用并不显著。研究结果显示，生物表面活性剂及其产生菌在土壤疏水性有机污染物的修复中有着潜在的应用价值。
2.进行了表面活性剂产生菌B.subtilis BS1和丛枝菌根真菌G. etunicatum联用治理土壤菲(Phenanthrene)污染的研究。体外试验结果显示，在菲存在时，B.subtilis BS1能够促进AMF萌发菌丝的生长。接种BS1能够提高植物生物量，促进菲在土壤里面的迁移，增加根际土壤中菲的含量，从而更容易在菌根际所降解。而G. etunicatum的接种能够显著增加土壤过氧化氢酶和多酚氧化酶酶活，促进植物生长，增加植物代谢活力，从而加强对菲的降解能力。BS1和G. etunicatum双接种的处理中，土壤菲残留量最少，显示出最强的修复能力。因此BS1和AMF联用治理土壤PAHs污染是一个非常有潜力的治理方法。
3.研究了生物防治菌株Bacillus subtilis JA在盆栽和体外条件下对丛枝菌根真菌的影响。试验发现，在盆栽条件下接种B.subtilis JA能够抑制土生丛枝菌根真菌真菌对宿主玉米(Zea mays L.)根的侵染，同时还减少了玉米地上部分生物量。但是对根内菌丝的侵染密度却没有多大影响。在体外双隔培养条件下，B.subtilis JA所产生的气体挥发物能够显著抑制孢子萌发和菌丝生长。而B。subtilis JA和G. etunicatum直接相互作用的结果显示，B.subtilis JA所分泌的水溶性抗菌脂肽fengycin同样能够影响AMF的发育。因此，抗真菌的芽胞杆菌生防菌株用于农业应用需要考虑其与土壤有益真菌之间的生物相容性。