从杭州西溪湿地采集沉积物样品,利用MiSeq高通量测序技术,对6个沉积物样品中所含细菌的丰度及多样性进行了研究。通过对16S rRNA的V3及V4两个区域进行测序,获得74905条有效序列,产生的OTU数目为4274个。对OTU进行分类学分析,结果显示沉积物样品具有很高的物种多样性,涵盖了30个门252个属的细菌。变形菌门(Proteobacteria)是各样品的优势类群,所占比例高达31.55%-62.67%,其中,以β、γ、δ-变形菌纲占主导地位,并在这些类群中发现大量与N、S等元素代谢相关的菌群。此外,六个样品中有3.25%-5.61%属于无法确定分类位置(Unclassified)的类群,说明西溪湿地沉积物中蕴藏有潜在新物种。通过比较6个沉积物样品细菌群落间的相似性,发现1和4号、2号和3号、5号和6号样品相似性较高,在系统发育树中聚为同一分支。采用4种不同类型培养基,共分离得到191株细菌纯培养物,经16S rRNA基因测序和系统发育分析,可归于13个不同的属。其中,优势种属为根瘤菌属(Rhizobium),占总数的39.27%,其次是假单胞菌属(Pseudomonas),占总数的26.70%。4种培养基上分离得到的细菌种类为R2A培养基最多,共有11个不同的属,其次是NB培养基,有8个属,M1和DNB培养基都是7个属。从分离的菌株中进行了脱氮菌的筛选,共得到5株总氮降解较好的菌株,其中M307菌株的降解率最高,达到了78.5%。进一步对M307菌株的异养硝化特性进行了研究,结果显示,在氨氮起始浓度为180 mg/L,培养至36 h,氨氮可全部去除,且系统中没有硝氮及亚硝氮的积累。经16S rRNA基因测序、形态及生理生化特性研究,初步鉴定M307菌株为假单胞菌属(Pseudomonas)。