胃蛋白酶ssDNA适配子的筛选鉴定

来源 :扬州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qwertasdfg122
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
胃出血是常见的危重消化道疾病,由于胃出血点所处环境特殊,强酸性的胃液和高活性的胃蛋白酶使凝血酶无法发挥作用,因此,抑制胃蛋白酶活性为治疗该类疾病的关键;此外,胃出血患者血清中的胃蛋白酶含量远高于正常人,用特异性的结合物检测血清胃蛋白酶变化,亦是临床无痛诊断胃出血疾病的有效手段。核酸类适配子为一些具有高级结构的单链DNA或RNA的寡核苷酸链,因其性质稳定、以高特异性和高亲和力与靶物质结合,目前已在临床上用于诊断和治疗各种疾病。本文旨在利用指数富集配基系统的进化技术(Systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX),将与磁珠偶联的胃蛋白酶作为靶分子,从体外80 nt(nucleotide)的随机寡核苷酸(DNA)文库中,筛选鉴定出与胃蛋白酶特异性结合的适配子:然后将适配子上标记生物素分子,建立胃蛋白酶的ELADA(Enzyme-linked aptamer direct assay)检测方法;并筛选出抑制胃蛋白酶功能位点适配子,为胃出血症的临床诊断和应用奠定基础。研究结果如下:1.将1mg/mL胃蛋白酶包被于Dynal磁珠,并用BCA(考马斯亮蓝)法检测胃蛋白酶的包被效率。包被完成后,未被包被的胃蛋白酶浓度仅为0.0191mg/mL,即98.09%的胃蛋白酶偶联到磁珠上,这使适配子筛选具有可行性。2.在体外设计一个两端各为20 nt,中间为40 nt的初始文库。80 nt的ssDNA经3%琼脂糖凝胶电泳后,条带的位置大概在核酸marker的50 bp附近;经过PCR扩增后,80 bp的dsDNA电泳条带的位置在的核酸marker的100 bp附近。3.通过梯度PCR反应,确定PCR扩增过程中具体参数。对称PCR技术的最佳反应条件是:退火温度58℃,循环次数30次;而不对称PCR技术的循环次数为40,最佳的引物比为P1:P2=100:1。4.以偶联到磁珠的胃蛋白酶为靶标,采用磁珠分离,通过磁力架分离与胃蛋白酶结合和未结合的ssDNA,整个筛选一共进行13轮,首次筛选时,ssDNA与胃蛋白酶的结合率只有1.48%,随着筛选次数的增多,ssDNA与胃蛋白酶结合率逐渐升高,第13次的适配子结合率最高,为73.57%,说明已经成功筛选到胃蛋白酶的候ssDNA选适配子。5.将第13轮筛选产物分别进行扩增、纯化、TA克隆、“蓝白”斑选择、测序等一系列操作,有27条序列被测出。除去中间随机序列的碱基数不足40个碱基的序列,最终成功得到8条可能的胃蛋白酶适配子(序号分别为NO.1,NO.5,NO.6,NO.9,NO.11,NO.15,NO.21,NO.26)。6.分析候选适配子的一级和二级结构,发现这8条适配子的一级结构同源性仅为43.3%,二级结构主要为茎环结构。7.用药典2000方法测定适配子对胃蛋白酶的抑制情况,结果表明8条适配子中仅有3条适配子(NO.5,NO.6,NO.21)对胃蛋白酶活性有较高的抑制作用。测定3条适配子半抑制浓度,得出21号适配子对胃蛋白酶的抑制率最高。8.生物素标记适配子,依照胃蛋白酶(其他蛋白质)-适配子-生物素-亲合素-辣根过氧化酶-底物结合反应步骤,应用ELADA方法测定不同蛋白质与适配子的结合情况。发现这3条适配子只对胃蛋白酶有很高的特异性(显著性p<0.01),其中21号适配子的特异性最强。结论:本研究基于指数富集配基的系统进化(SELEX)技术,以磁珠作为介质进行适配子分离,在中间过程中加入反筛,有效减少非特异性结合,经十三轮筛选,筛选出针对胃蛋白酶的ssDNA适配子,在国内外尚属首次;运用药典2000方法,鉴定适配子对胃蛋白酶活力的抑制作用,同时建立胃蛋白酶适配子特异性检测方法,验证筛选到特异性和抑制率都最高的21号适配子。这些结果为后期研究胃蛋白酶的ssDNA适配子对胃出血治疗和诊断提供一定基础。
其他文献
本期选刊的两篇文章均围绕中国绘画史上的"重要"人物展开,如何见出新意是极见研究功力的。林通雁的《荆浩与太行山》,通过对近年相关学者对该选题的考察和研究成果的梳理,结
某铅锌矿位于广西田林,处云贵高原东缘。在综合前人资料的基础上,结合野外和室内工作,对该铅锌矿的地质特征和控矿因素进行探讨。
固定资产作为银行最为基本和重要的要素,相关信息则是开展业务活动必须具有的资料信息,加强固定资产信息管理,提高央行资产使用效益,降低央行履职成本具有积极的促进作用。而
目的:主要研究低频电脉冲技术对产后催乳与子宫复旧作用的实际应用。方法对56例的相应患者进行综合性的治疗指导乳汁比较充足为终止,通常情况下位3次,而在实际对照组中不应该采
目的:建立MPTP诱导小鼠帕金森病模型,在帕金森病发病及预运动训练干预帕金森病过程中,观察抗增殖蛋白2、线粒体自噬与融合分裂相关蛋白之间的关系,以期揭示帕金森病的线粒体机制,并观察预运动跑台训练能否减轻帕金森病的症状,为运动干预帕金森提供理论依据。方法:选取体重为20-25g的C57bl/6雄性小鼠120只(青年小鼠,8周龄),随机分为对照组(C,n=60)和预运动训练组(PM,n=60),分笼饲
伴随移动环境的发展和移动终端的普及,短视频已经成为当前内容消费的主要对象之一。短视频以其易于切换、便于即时观看以及可嵌入性等特点,不断吸引着人们的注意力。文章以短
大学教育的目的是为了培养完全的人,只有专业教育与通识教育的有机结合,才能实现"德才兼备、全面发展"的人才培养目标。幸福心理学通识课程的开设,有助于提高大学生心理健康
随着我国国有企业改革的不断推进,混合所有制改革进入到深水区,但仍面临多重矛盾和问题。本文以马克思主义所有制理论为分析框架,以马克思的产权理论为指导,从混合所有制改革中的问题发端,在缕析改革成效的基础上,对国有企业推进混合所有制改革存在的问题、实践探索的难点进行研究和分析,进而从加强党组织引领,完善现代企业制度,强化国有资产监管,改善改革环境,健全企业治理机制,防范国有资产流失等方面,提出意见和建议
<正>县级政协组织处于政协工作最前沿,新形势下,县级政协党建工作要聚焦多党合作、政治协商、履职为民,只有始终加强党对一切工作的领导,才能在更高水平上实现思想上的统一、