新型农村合作医疗制度是由政府组织、引导和支持,农民自愿参加,个人、集体和政府多方筹资,以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度,是目前我国农村基本医疗保障的主要形式。7年多的试点表明,新型农村合作医疗对于改善农村卫生状况、提高农村劳动力素质、解决农民“因病致贫、因病返贫”等问题具有非常重要的作用。但同时也暴露出许多问题,制约着新型农村合作医疗制度的可持续发展。政府作为新型农村合作医疗政策的执行者,承担着提供资金支持、监管、立法等一系列责任,其责任是否到位,不仅直接影响新型农村合作医疗政策的落实程度,还关系到整个农村医疗卫生事业的发展以及社会主义和谐社会的建立。按照政府履职情况,我国农村合作医疗制度可以划分为“全责包办”时期、“医疗市场化”时期、“重建医疗合作制度”时期(新型农村合作医疗时期)三个历史阶段。其中,“重建医疗合作制度”时期,受原有意识的思维惯性、长期形成的行为惯性、现实条件的局限性以及财权事权不统一等因素的制约,政府在履职时还存在一些不足:立法层次低、缺乏统一的法律规范、制度设计尚有许多不足、基层政府财政负担沉重、监管机制不完善等。针对以上种种问题,我国可以在借鉴国外先进经验的基础上,综合本国国情,通过推动《新型农村合作医疗法》的出台、建立以《新型农村合作医疗法》为基础的多层立法体系、优化制度设计、加大投资,明确各级政府责任、理顺新型农村合作医疗管理体制、完善新型农村合作医疗基金监督管理、加强对卫生服务行为的监管等措施,确保新型农村合作医疗制度健康发展,完善政府在新型农村合作医疗制度中的责任。