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目的:掌握不同动物源和人源金黄色葡萄球菌(简称金葡菌)的耐药和毒素基因流行情况;并比较不同来源菌株之间的分子型别和分子特征的差异,以揭示不同来源金葡菌的特异性表型和分子标志物。为预测动物相关金葡菌跨种属传播风险提供重要理论依据,以有效控制和遏制动物相关金葡菌向人群传播。方法:采用横断面研究设计,对广东省珠三角地区4个城市(深圳市、佛山市、东莞市、江门市)的动物和人群进行鼻拭子采样。所有金葡菌进行抗生素敏感性试验,运用PCR扩增技术检测耐药基因(erm(A)/erm(C)、linA等)、超抗原毒素基因(中毒性休克综合征毒素基因tsst1和肠毒素基因sea、seb、sec等)、免疫逃逸集群(IEC)基因(scn、chp、sak、sea、sep)、溶血毒素基因(hla、hlb、hld)杀白细胞毒素pvl基因、粘附因子相关基因(bbp、clfA、cna等);应用多位点序列分型MLST实验得到金葡菌的分子型别。采用χ~2检验或者确切概率法、logistic回归进行各组率的比较,通过对应分析揭示不同来源金葡菌中CC分型和表型-分子特征之间的对应关系。研究金葡菌来源(动物源、人源)的影响因素时,先利用随机森林方法对影响因素进行重要性排序,再用分类与回归树和logistic回归揭示各影响因素之间的高阶交互作用。动物中CC9金葡菌定义为动物源金葡菌,人群中non-CC9金葡菌定义为人源金葡菌。结果:1、检出率和分子型别:人群中金葡菌检出率为16.6%,MRSA为5.3%,主要克隆群是为CC188(30株)、CC7(28株)、CC59(27株)、CC6(25株);动物中金葡菌检出率为7.6%,MRSA为5.1%,主要克隆群是CC9。2、人源和动物源金葡菌菌株的表型和分子特征的差异性比较:动物源菌株的耐药率明显高于人源菌株(克林霉素、四环素、红霉素、新诺明、庆大霉素等);动物源菌株耐药基因携带率明显高于人源菌株(tet(M)、aacA-aphD、erm(C)、msra等);但是人源菌株的IEC基因(scn、chp和sep)、肠毒素基因(sea、sek和sep)、粘附因子基因(bbp、clfA和spa)和溶血毒素基因(hla、hlb和hld)的携带率明显高于动物源菌株。3、动物源和人源中金葡菌克隆型与表型-分子特征的对应分析提示:动物源菌株与XDR相关,而人源菌株主要与non-MDR相关;人源菌株和动物源菌株表现为携带较少肠毒素基因,其中人源CC1菌株与携带2个肠毒素基因相关,人源CC6/CC7/CC59/CC188菌株与携带0-1个肠毒素基因相关,动物源菌株与携带1个肠毒素基因相关;人源CC7菌株与携带2个粘附基因相关,人源CC1/CC5/CC15/CC59/CC188菌株与携带1个粘附基因相关,而动物源菌株与粘附基因的缺失相关;人源CC15菌株与携带4-5个IEC基因相关,人源CC1/CC6/CC7/CC188菌株与携带3个IEC基因相关,而动物源菌株与携带1-2个IEC基因相关;人源CC1/CC59/CC188/CC6/CC7菌株与携带3个溶血毒素基因相关,人源CC5菌株与携带2个溶血毒素基因相关,而动物源菌株与携带2个溶血毒素基因相关。4、随机森林对揭示菌株来源的影响因素进行重要性排序:耐药表型中复方新诺明和四环素耐药的重要性相对较高;耐药基因中aacA-aphD和tet(K)、tet(M)的指数排序较前;IEC基因中scn和sep基因的重要性最高;肠毒素基因中seh、sem和sek基因影响最重要;溶血毒素基因中hld基因重要性最高;粘附因子基因中spa基因的重要性最高。5、分类与回归树结合logistic回归探究菌株来源影响因素的潜在交互作用:动物源金葡菌中新诺明-四环素同时耐药(OR=508.08)、(aacA-aphD)-tet(M)同时携带比例(OR=1332.00)均明显高于人源菌株;动物源金葡菌具有scn(-)-sep(-)-chp(+)的IEC组合(OR=1.88)、seh(+)-sek(-)肠毒素组合(OR=87.50)、不携带hld基因(OR=20.96)比例均明显高于人源菌株。结论:1、人源和动物源金葡菌的表型和分子特征的差异性比较提示,动物源菌株比人源菌株的耐药率更高;动物源菌株携带耐药基因比例比人源菌株更高;但是,人源菌株的IEC基因、肠毒素基因粘附因子基因和溶血毒素基因的携带率普遍高于动物源菌株。2、对应分析揭示不同克隆型与表型-分子特征间关联性:动物源金葡菌与XDR相关,而人源金葡菌主要与non-MDR相关,提示动物相关菌株的耐药问题不容忽视;人源金葡菌与携带4-5个IEC基因、携带1-2个粘附因子基因密切相关,而动物源菌株则表现为普遍缺失这些毒素基因;hla、hlb和hld溶血素基因普遍存在于人源和动物源菌株中。3、分类与回归树结合logistic回归探究表型-分子特征间不同组合在人源和动物源菌株中作用,动物源金葡菌中新诺明-四环素同时耐药比例、(aacA-aphD)-tet(M)同时携带比例均明显高于人源菌株;动物源金葡菌具有scn(-)-sep(-)-chp(+)的IEC组合、seh(+)-sek(-)肠毒素组合、不携带hld基因比例均明显高于人源菌株。