微生物生长和新陈代谢、细胞表面的特性及可以沉淀矿物和捕获颗粒的细胞外聚合物质（EPS）的交互作用产生了微生物碳酸盐岩。微生物碳酸盐岩内残留了各种微生物印迹,代表了极为复杂的形成机制,促使微生物碳酸盐岩成为当前沉积学研究的热点之一。在参加国家自然科学基金会资助项目的过程中,对辽东半岛及邻区寒武系芙蓉统微生物岩开展了系统的野外及室内研究。研究区微生物岩多以生物丘的形式发育于浅缓坡环境中,多为均一石、凝块石和叠层石所构成;更为有趣的是,这些宏观上显示为简单特征的块状微生物岩,表现出复杂的微观组构。在显微镜下,观察到生物丘内发育了多种特殊的组分,包括钙化微生物、可疑的Lithocodium、底栖鲕粒、核形石、皮壳粒、球粒及凝聚颗粒。钙化微生物包括Girvanella、Epiphyton、Renalcis和Subtifloria。其中,Epiphyton的大量出现,修订了“Epiphyton在寒武纪第三世末期可能灭绝”的结论性认识。钙化蓝细菌参与形成的颗粒,进一步证明了这些颗粒的微生物成因。不同类型的底栖鲕粒和核形石的形成,表明了微生物席内各种生物膜的复杂钙化作用机制。以各种类型的颗粒为底质的皮壳粒,展示了建设性和破坏性微生物印迹。不同类型的球粒展示了不同成因:（1）生物碎屑泥晶化球粒,破坏性泥晶化作用的产物;（2）外部薄的泥晶鞘包覆粗粒方解石核心的囊状球粒,微生物活动的产物;（3）由致密泥晶形成的球粒,细菌作用的产物。微叠层石,说明生物丘内局部存在由微生物群落及其分泌的EPS形成的小型微生物席。纹层的形成可能与有利于碳酸盐沉淀的微生物新陈代谢活动（如生氧光合作用蓝细菌和硫酸盐还原细菌（SRB））及组成微生物席和生物膜的EPS的降解作用存在着复杂的成因联系。不连续凝块纹层是与微生物群落生长和腐烂相关的、不同时期的石化作用的产物,网状纹层的出现为弱水流对席颗粒的簸选。纹层中的暗色丝状泥晶可能代表了钙化的EPS或与EPS有关的生物膜的钙化。生物丘内各种颗粒及致密泥晶中都可见黄铁矿。黄铁矿与局部出现的大量白云石,表明了生物丘形成过程中SRB的作用。生物丘内复杂的显微组构及泥晶的复杂成因,表明了生物丘形成过程中所经历的复杂的微生物活动与微生物作用。由于寒武系中与微生物膜和微生物席复杂的钙化作用机理相关的微生物岩,多产在正常浅海环境中,缺乏现代类比物,就像Epiphyton是归为蓝细菌还是归为红藻的强烈争论那样,本文的若干新发现和探索性研究为今后的深入研究提供了重要的线索和思考途径。