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大豆花叶病毒病(SMV)是世界性病害,在我国东北大豆主产区普遍发生,严重影响大豆的品质和产量。利用抗病品种是控制SMV最经济有效的措施。但目前存在主栽品种遗传基础狭窄,抗性资源匮乏,通过常规育种方法培育抗病品种时间长、效率低等问题。分子标记辅助选择是新兴的育种技术,可以有效地提高育种效果,缩短育种年限。本研究通过对抗感杂交组合后代的抗病性分析,研究抗SMV N3强毒株系的中选95-5117成株抗性及抗SMV N1优势株系的东农93-046成株抗性和种粒斑驳抗性遗传规律,以及抗病性与农艺性状间的相关;分析病毒侵染抗感品种叶片细胞的超微结构变化;筛选出与SMV N1、N3抗性基因紧密连锁的SSR分子标记,并定位在连锁群上;构建了两个大豆遗传连锁图谱,对基因定位结果进行验证;利用本研究获得的与抗病相关SSR标记对70份大豆资源和杂交F3代家系进行了抗病性鉴定,证明利用抗性相关的SSR标记进行抗病毒分子辅助选择育种的可行性。具体研究结果如下:1.利用SMV N3强毒株系对中选95-5117×HB1的杂交后代F5和F6群体进行了抗病性鉴定,结果表明:抗病家系与感病家系分离符合1:1的理论比例,说明中选95-5117对SMV N3株系的抗性受一对基因控制。利用SMV N1优势株系对合丰25×东农93-046的F1、F2和F2﹕3群体进行了抗病性鉴定,结果表明:F1植株在接种后表现抗病,经χ2测验,F2群体分离比例为3(抗)﹕1(感);对F2代衍生的F2﹕3家系接种鉴定,纯合抗病家系、抗感分离家系和纯合感病家系的比率符合1﹕2﹕1,表明东农93-046对SMV N1株系的成株抗性受一对显性基因控制。利用SMV N1优势株系对东农93-046×Conrad的正反交组合F2代进行成株抗性和种粒斑驳抗性鉴定,结果正反交后代均表现为3﹕1的分离比例,无细胞质效应,进一步证明了东农93-046是受一对显性基因控制的抗性亲本材料。以东农93-046×Conrad的正反交F2代为材料,研究农艺性状与成株抗性和种粒斑驳抗性之间的关系,结果表明:荚茸毛密度与成株抗性和种粒斑驳抗性均存在极显著的正相关,用该性状可以作为评价材料抗性的重要参数。成株抗性和种粒斑驳抗性之间也存在极显著的正相关。2.利用透射电镜技术,对接种SMV N1和N3株系21 d后抗感品种的细胞超微结构变化进行了检测,结果表明SMV N3株系比N1株系对感病品种合丰25的细胞超微结构破坏更严重,主要包括:叶绿体肿胀,片层严重扭曲,变模糊不清,叶绿体膜瓦解,仅剩片层结构,嗜锇颗粒增加较多,有大量的风轮状内含体出现,产生大量的束丝包裹病毒粒子,线粒体数目增加较多,细胞核核膜降解,核仁完全融解等。而抗病品种东农93-046接种SMV N3株系和N1株系21 d后细胞超微结构破坏较轻,但接种N3株系要比接种N1株系细胞超微结构变化更明显,主要包括:少数细胞出现核质轻微边聚、线粒体增多,叶绿体片层有部分断裂,嗜锇颗粒增加,并分为3种状态,叶绿体外膜产生异形增生物,出现小泡囊等。3.利用改良的BSA法,通过600对SSR引物对中选95-5117×HB1组合的117个F5代