建立基因序列函数并识别阿尔茨海默病致病基因

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阿尔茨海默病是痴呆病中最普通、最常见的一种。患者表现为记忆力逐渐衰退甚至丧失,认知功能受阻。据2010年的统计数据显示,我国的老年痴呆症患者已己超过600万人。阿尔茨海默病已成为威胁老年人健康的最主要的疾病之一,目前还没有治疗阿尔茨海默病的有效办法。因此,寻找治疗阿尔茨海默病的根本方法已迫在眉睫。已有研究证明,了解阿尔茨海默病的致病原理,是寻找有效治疗方法的根本途径。其关键在于识别阿尔茨海默病的致病基因。通过基因芯片技术得到的基因表达数据庞大,样本众多,要快速找到阿尔茨海默病的候选致病基因必须找到一个恰当的切入点。如果找到与已知致病基因相关的基因,其很有可能是阿尔茨海默病的候选致病基因。目前已经被证实的阿尔茨海默病的致病基因有载脂蛋白E(APOE),早老素基因1(presenilins1)和早老素基因2(presenilins2)。本文正是以已知的致病基因为中心,设计算法,找出与已知致病基因相关的基因,作为为生物验证的候选基因。主要研究内容如下:首先,理解并掌握基本蚁群算法的原理、模型及实现步骤,了解本文的数据来源和掌握数据结构;其次,建立基因序列函数,结合基本蚁群算法和K均值聚类算法创建本文独有的算法模式,并对本文设计的算法进行修改、完善。最后,利用本文的算法,找到已知致病基因的伴随基因,即阿尔茨海默病的候选致病基因,得出结论。
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