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本研究筛选到五株能在低温条件下生长的菌株。从中国科学院微生物研究所原有保藏的菌种库中筛选到一株能在低温下高效降解淀粉的菌株AS1.2372,从南极土壤样品中筛选到一株能以苯酚为唯一碳源和能源生长的菌株BF4和一株能以苯胺为唯一碳源、能源和氮源生长的菌株BA6,从低温海水样品中筛选到两株能利用吐温80的菌株E3和H6。
筛选到的菌株AS1.2372有很好的降解淀粉和蛋白质的能力。对它的最适生长温度,最佳降解pH,降解温度以及不同浓度淀粉降解效率的研究发现,菌株在较低的温度下有很好的降解淀粉的效果,在5 g/L的淀粉培养基中培养到第五天左右时能将培养基中的淀粉基本消耗完。菌株在18℃时降解效果最好,最适生长初始pH为7.5左右。在初始淀粉浓度<10 g/L时降解效率很高,能达到90%以上,随着浓度再提高,降解效率有所降低,到30 g/L时大概只有一半淀粉能被利用。对苯胺BA6和苯酚BF4的降解条件、耐受浓度以及底物范围进行研究,发现菌株BA6在pH7.5左右时生长最好,菌株BF4在pH8.0左右时生长最好。菌株在苯胺和苯酚浓度较低(300 mg/L)时生长较好,高浓度对生长有抑制作用。底物范围测定表明这两株菌还能利用其他一些芳烃化合物,如2,5-二苯基噁唑、2-亚硝基-1-萘酚、1-亚硝基-2-萘酚、苯甲酸和1-(2-吡啶偶氮)-2-萘酚等。根据菌株16S rRNA基因的相似性初步将BA6和BF4分别鉴定为不动杆菌和假单胞菌。通过测定菌株在LB培养基中的最适生长温度表明,所筛菌应该属于耐冷菌。
基于16S rRNA基因序列的系统发育分析,菌株E3和H6可能分别代表了Glaciecola属和Lishizhenia属的新的分类单元。对菌株E3和H6的形态特征、生理及生化特征、极性脂组成、16S rRNA基因序列和DNA-DNA同源性进行研究以阐明这两株菌的分类地位。结果表明,菌株E3与最相近菌株G. chathamense S18K6T的16S rRNA基因的相似性为94.6%,G+Cmol%为40.8%,主要脂肪酸为Sum3(C16:1ω7c and/or iso-C15:02-OH)、C18:1ω7c和C16:0。主要极性脂为磷脂酰乙醇胺phosphatidylethanolamine(PE)和磷脂酰甘油phosphatidylglycerol(PG),与属内其它种相同。但菌株E3T还含有一种未知的糖脂unknown glycolipid(GL1),同时不含二磷脂酰甘油diphosphatidylglycerol(DPG);菌株H6与最相近菌株Lishizheniacaseinilytica JCM13821T的16S rRNA基因的相似性为97.8%,G+Cmol%为34.6%,与Lishizhenia caseinilytica JCM13821T的DNA同源性为47.4%,主要脂肪酸为i15:0、i15:1和3-OH i17:0,含有类胡萝卜素,主要呼吸醌为MK-6。结果分析表明这两株菌应为新种,分别命名为:Glaciecola lipolytica sp.nov(E3T)和Lishizhenia tianjinensesp.nov(H6T)。