食源性致病菌是危害食品安全和人类健康的主要因素。常见的食源性致病菌主要包括金黄色葡萄球菌、副溶血弧菌、单核细胞增生李斯特菌、沙门氏菌、阪崎肠杆菌、志贺氏菌、肠出血性大肠杆菌O157:H7和空肠弯曲杆菌。本研究利用基因组比对方法挖掘食源性致病菌基因组中的特异性序列,建立食源性致病菌检测靶点筛选库,设计和筛选相关PCR特异性引物。同时整合已报道的检测靶点和引物,利用筛选和整合的引物建立并优化多重PCR体系和基因芯片方法,检测上述八种食源性致病菌。主要研究结果如下:1、多重PCR检测体系。利用筛选的引物nuc-j,Vp2,prs,C20,SG,ial,hly-A和hipO1,建立和优化了八种食源性致病菌多重PCR检测体系,经优化后确定退火温度Tm值和Mg²⁺浓度分别为56oC和1.5 mmol/l,多重基因组DNA检测灵敏度可达到10 pg。2、基于单碱基延伸标签反应的基因芯片方法。通过多重PCR和基因芯片技术联用,设计SBE-tags引物进行荧光标记反应,建立八种食源性致病菌的基因芯片检测方法。芯片多重基因组DNA检测灵敏度和细菌纯培养物灵敏度分别为0.1 pg和5.0×102 cfu/ml,分离菌株检测符合率达到100%。3、管式流动芯片检测方法。应用管式流动芯片系统验证检测八种食源性致病菌,检测高效特异,细菌纯培养物灵敏度可达到6.2×102 cfu/ml。相比较基于单碱基延伸标签反应的基因芯片方法,管式流动芯片检测时间短,自动化程度高。