中国（上海）自由贸易试验区的批复是我国对外开放的又一重大战略，对我国经济发展，上海广泛参与国际竞争，国际航运和国际金融双中心建设具有深远的意义。自由贸易区对港口物流业的影响更是直接、长远且重大的，对国家转口贸易、离岸贸易、离岸金融和航运服务有极大的促进作用。首先，本文分析了贸易与港口物流业的相关性及国外自由贸易区概念、实践形式、发展历程，与港口物流企业的重要关系，并指出国外自由贸易区对我国港口物流业发展的启示。其次，本文重点分析上海自贸区制度与政策创新对港口物流企业转型发展的影响，包括对我国海关特殊监管区域政策进行梳理，将自由贸易区政策与之前的政策进行比较等。第三，本文梳理了企业价值相关概念和主要反映指标，简要介绍企业价值评估的主要模型，并分析了自贸区对港口物流企业的价值影响。第四，本文选择上港集团作为案例进行价值影响实例分析。最后，基于全文的分析，结合案例实际，给出港口物流企业转型发展和价值提升的建议。