公司控制权理论是现代公司治理理论的重要组成部分。上市公司的控制权配置在股东、董事会、经理层三个层次上,这三大经济主体间的制衡关系共同构成了公司内部控制权配置的总体框架。本文对上市公司控股股东内部控制权配置的有机整体进行了有意义的探索,为控制权研究提供了经验证据。本文研究可以发现我国上市公司主要的公司治理问题和制度安排的缺陷。一方面可以为政府部门提供决策制定、制度设计的参考意见；另一方面通过优化公司内部控制权的配置,可以为完善我国公司治理,提高公司绩效和运行效率提供理论支持和实践指导。本文首先阐述了控制权的定义和股东、董事会、经理层三个层面的控制权配置框架。然后理论分析了股权分置改革对我国上市公司控制权配置主体的影响。接着利用中国上市公司的实际数据,实证研究了股权分置改革对我国上市公司控股股东控制权配置的影响。通过研究,本文得出如下结论：我国上市公司的控制权基本掌握在控股股东手中,其他股东对控股股东的制约能力相对较弱。股权分置改革促进了股权结构的优化。股权分置改革后,控股股东持股比例（Topl）有所下降且下降趋势明显；Herfindahl₁0指数有明显下降,说明股改后前10位股东的持股比例差距有所缩小；Z指数下降较多,说明控股股东与第二大股东控制权有所接近,控股股东对公司的控制能力明显下降；我国上市公司控股股东为国有股的国有股“一股独大”局面并未改变,但有所缓和。总之,股改一定程度上分散了控股权,股权结构由过度集中向适度集中转变,趋于合理,这正是股权分置改革的一大目的。从绝对人数和相对比例来看,股改后董事会受控股股东的控制在加强,即股改后样本公司控股股东在董事会层次的控制权配置得到加强。样本公司中董事长和总经理两职完全分离的占绝大多数,两职合一的占最少。样本公司中总经理在控股股东单位任职的公司数量所占比例不是很大,即总经理由控股股东直接委派的比例并不是特别高。股改后样本公司控股股东在经理层层次的控制权配置得到减弱。股权分置改革对控股股东控制权配置的影响显著。最后,本文提出了优化控股股东控制权配置的几点政策性建议并指明了进一步研究方向。建议包括：降低国有股权集中度,形成股权制衡；股权要适度集中；提高董事会的独立性、增强董事会的功能；完善经理层选任机制；加强利益相关者在公司控制权配置中的作用；鼓励机构投资者积极参与上市公司治理；强化优化股权结构的市场环境建设。不断优化控股股东控制权配置是一个永恒的课题,后续研究可以结合金融危机这一影响因素,分行业分析股权分置改革对各行业上市公司控股股东控制权配置的影响,这也为本文指明了进一步研究的方向。