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杀鱼爱德华氏菌(Edwardsiella piscicida)是一种对水产养殖业极大危害的致病菌,其致病过程是一系列致病基因时空顺序表达的结果。Ⅲ型分泌系统(T3SS)和Ⅵ型分泌系统(T6SS)是目前已知的重要的毒力因子,而EsrA-EsrB双组分系统对T3SS及T6SS表达有关键调控作用,但EsrB单独在E.piscicida中对下游的调控还不明确。本文运用RNA-seq技术对DMEM培养条件下的E.piscicida EIB202的转录谱进行分析,筛选出618个基因的转录水平在△esrB中下调,而388个基因在其中上调。EsrB除了能上调T3SS和T6SS之外,还能上调铁摄取相关基因,这说明铁也参与了该病原菌毒力调控基因的表达。Fur蛋白为铁摄取调节子。在转录水平上,fur在WT中的表达量比在AesrB中显著上调4倍以上,表明EsrB对Fur具有上调作用。作为一种全局调控因子(global regulator),Fur严格抑制许多基因的表达,保证铁转运系统受到铁浓度的严格调控。本实验运用ChIP-seq技术,考察了E.piscicida EIB202中Fur在全基因组范围内的结合位点以及对下游基因的可能调控作用。通过对ChIP富集获得的98个DNA片段结果的统计分析,得到了 Fur直接结合的DNA序列logo图,同时通过KEGG途径分析,绘制了 Fur的全局调控网络图。此外,还通过胞内cAMP的测定确定了 Fur能通过icc(cpdA)进而调控胞内第二信使—cAMP的水平,充分证明Fur能直接或间接广泛参与菌体的各种生理代谢和毒力调控。与此同时,本文为了初步验证RNA-seq结果,还通过双向电泳技术进行了蛋白组学分析,鉴定了E.pscicida中受EsrB调控的19个蛋白。转录组和蛋白质组数据充分表明,EsrB能抑制GlnA(谷氨酰胺合成酶)的表达,表明EsrB与E.piscicida的氮代谢途径密切相关,这为我们更好地研究病原菌的致病机理提供了新的思路。