鸡apoAV基因的多态及其与鸡屠体性状的关联分析

来源 :中国农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hulin510
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载脂蛋白AV基因(apolipoproteinAV,apoAV)是一个通过生物信息学比对而发现的新基因,在人、鼠中与血浆甘油三酯(TG)浓度有极大相关。本研究利用候选基因法,根据GenBank上预测的鸡apoAV基因序列设计引物,利用PCR-SSCP筛选鸡apoAV 5-调控区、第一外显子、第二内含子和第二外显子的多态,并与鸡屠体性状进行了关联分析。结果如下: (1)三对引物所扩增的片段皆有多态性。用引物ApoAlL/R在5-调控区检测到3种基因型,对纯合型个体进行回收测序后发现该片段-169位核苷酸发生突变,为C→T的转换;用引物ApoA2L瓜在第一外显子上没有检测到多态性,但发现在第二内含子第29位核苷酸由T突变为C;用引物ApoA3L/R检测,发现第二外显子600位核苷酸由C突变为T,所编码的氨基酸没有发生变化,为同义突变;第635位核苷酸由T突变为C,氨基酸由亮氨酸变为脯氨酸,为错义突变。 (2)在中国农业大学CAU资源群体(白洛克和丝羽乌骨鸡正反交F2代)中,ApoAlL/R扩增片段多态性位点的基因型频率分别为MM型0.59,MN型0.27,NN型0.14,等位基因频率M为0.72,N为0.28;ApoA2L/R扩增片段多态性位点基因型频率分别为EE型0.17,EF型0.56,FF型0.28,E和F等位基因频率分别为0.45和0.55;ApoA3L/R扩增片段多态性位点基因型频率分别为AA型0.48,AB型0.31,AC型0.09,BB型0.05,BC型0.04,CC型0.03。A,B,C的等位基因频率分别为0.68,0.23,0.09。经卡方检验,这三个位点均符合Hardy-Weinberg平衡。 (3)ADoAlL/R位点基因型对12周龄的屠体性状没有显著影响。ApoA2L/R位点基因型对12周龄的肝重有显著影响(P<0.05):FF型的肝重显著低于EE型和EF型肝重。ApoA3L/R位点基因型对腹脂重、肝重、心重有显著影响:CC型的腹脂重、腹脂率显著高于AA型、AB型、AC型、BC型的腹脂重、腹脂率;AC型的肝重显著低于AA型、AB型、BB型、BC型和CC型的肝重, BC型的心重显著低于BB型的心重。本研究结果表明,鸡载脂蛋白AV基因是影响脂肪代谢和屠体品质的重要功能基因,今后应继续开展表达调控机理方面的研究。
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