串联18O同位素标记应用于定量糖蛋白质组研究

来源 :复旦大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hong_77521
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
近年来,随着蛋白质组学(proteomics)的快速发展,蛋白质的翻译后修饰引起了越来越多的关注,特别是蛋白质糖基化修饰。蛋白质的糖基化修饰是最常见、最重要的蛋白质翻译后修饰之一,在许多重要的生理和病理过程中起着重要的作用。随着糖蛋白/糖肽富集技术和生物质谱技术等的发展,大规模N-型糖蛋白的糖基化位点鉴定得以实现。但关于N-糖基化位点的糖基化程度定量,及糖基化程度变化和蛋白表达水平变化的关系研究的很少。基于此,本论文发展了一种串联18O稳定同位素标记方法(Tandem18O Stable Isotope Labeling,TOSIL),用于对N.糖基化位点的糖基化程度进行相对定量,并比较糖基化程度变化和蛋白表达水平变化的关系。   本论文由四部分组成。   第一章绪论首先介绍了蛋白质糖基化修饰研究现状,尤其对糖蛋白/糖肽及糖基化程度定量方面的研究进展做了综述;概述了卵巢癌的蛋白质组学研究进展,说明了本论文选题目的和意义。   第二章所述工作用两种标准糖蛋白发展了串联18O稳定同位素标记方法(TOSIL),用于对N-糖基化位点的糖基化程度进行定量。概括来说,两组对照的样品分别在H216O或H218O水中进行胰蛋白酶酶解和PNGase F释放糖链,两步酶解都在H218O水中处理的糖肽(仅含一个糖基化位点)会被标记上三个18O原子:两个位于肽段的C末端,一个标记在糖基化位点上。分别用16O或18O标记的糖肽对峰产生6 Da的差异,而非糖肽仅在C末端标记氧原子,产生4 Da的差异,由此可以明显的区分糖肽和非糖肽,并同时对糖基化水平和蛋白水平进行定量。用16O或18O标记的两组样品混合后用Nano-LC-ESI-MS/MS进行分析,利用PMF图谱中对峰的强度进行相对定量。对该方法重复性和准确性的考查结果显示,在10倍动态范围内该方法有很好的线性关系(r2>0.99)和重复性(SD在0.06到0.21之间)。TOSIL方法分析过程简单,易操作,引入了3个18O原子,减少了质谱峰的重叠,从而使得得到的定量信息足够准确。   第三章工作是将TOSIL方法用于实际样品的分析。对卵巢癌血清样品和正常人血清样品中的N-糖基化位点进行了糖基化程度的相对定量分析,总共得到了49个糖蛋白中86个糖基化位点的定量信息。并对比分析了糖基化程度的变化和对应的蛋白水平的变化,从中发现了一些有特殊变化的糖基化位点。此外,还用Western-blot对蛋白水平的变化进行了验证,结果显示与TOSIL方法得出的结论一致。说明此方法可以大规模用于实际样品的分析,得到的结果准确、可靠。   第四章是全文总结和展望。总结了主要的研究结果,设想了下一步研究的方向。
其他文献
目的 分析糖尿病患者应用生化检验临床效果.方法 选取 2018 年 1 月—2019 年 1 月本院诊治的 90 例糖尿病患者的临床资料,随机分为两组,对照组 45 例行常规检验,研究组 45
目的 研究标本采集时间和采集方法对小儿支气管肺痰细菌培养标本阳性率及准确率的影响分析.方法 选取 2018 年 1 月至 2019 年 1 月对我院检验科收集的小儿支气管肺炎痰细胞
介绍一种适用于小批量生产中,加工深孔渐开线花键的方法。 A method for processing deep involute splines in small batch production is introduced.
深入学习宣传贯彻党的十七大精神是当前和今后一个时期宣传思想文化战线的首要政治任务。中共中央政治局常委李长春在讲话中指出,必须采取有效措施,不断向深度和广度推进,推
目的 对急性脑梗死患者胱抑素C及凝血功能检验价值进行分析探讨.方法 以我院 2018 年 1 月~2019 年 12 月收治的 54 例急性脑梗死患者作为观察组,以同期在我院进行健康体检的
目的 研究分析化学发光免疫分析在甲状腺疾病的临床检验价值,为临床甲状腺检验提供依据.方法 2016 年 1 月至 2018 年 4 月我院对 345 例甲状腺疾病患者进行了分析研究,将患
目的 探讨克氏针张力带内固定术对髌骨骨折患者膝功能的影响.方法 择2016 年2 月-2017 年 11 月进入我院的髌骨骨折患者 70 例,均进行克氏针张力带内固定术治疗,比较治疗前后
天然核苷类化合物不但是DNA或RNA的结构片段,而且是许多酶活性调节物和代谢物的基本组成成分。因此,核苷分子是构成有机小分子探针的良好骨架。国内外许多课题组在进行核苷类荧光探针的研究和开发,并取得了一系列令人惊喜的成果,不仅为后续的研究提供了指导,而且使得核苷类荧光探针在药物化学、分析化学、生物化学和遗传生物学领域得到了广泛的应用。但是,目前用于检测黏度的核苷类荧光探针还鲜有报道。黏度是流体的一种
目的 分析在四肢骨关节骨折患者的影像诊断方法选择中,多层螺旋CT后处理技术的应用效果.方法 回顾性分析 2017 年 6 月-2019 年 6 月经手术证实的四肢骨关节骨折患者的图像资
目的 分析评价“品管圈”活动在提升门诊西药房药学服务质量中的作用.方法 本次将本门诊于 2018 年1 月-12 月接受常规药学服务的100 例患者作为对照组,将2019 年1 月-12 月