天目铁木(Ostrya rehderiana Chun)是中国最濒危的植物之一,目前仅有5个天然个体,分布于浙江西天目山。1980年代,研究人员利用种子萌发获得的幼苗进行天目铁木的迁地保护工作。现在,迁地保护工作已经获得大约175个个体的天目铁木人工种群。虽然通过种子萌发获得新个体的技术已经成熟,人工种群使得天目铁木在个体数量上得到增长,但是迄今为止还没有对天目铁木开展过任何以物种保护为目的的遗传学研究。由于遗传多样性对物种有重要意义,缺乏这方面的信息对天目铁木进行的工作在保护策略和保护效果评估问题上缺乏相应指导。在本研究中,使用AFLP技术揭示了天目铁木天然种群的遗传多样性现状,评估了天目铁木人工种群是否存在遗传多样性下降问题。另外通过亲本分析,评估各个天然个体将基因传递给子代的机会是否均等。汇总各项遗传多样性指标,多态位点百分比在自然种群中为29.9%,在人工种群中为41.18%。有效等位基本数在天然和人工种群中分别为1.242和1.208。平均每个个体的无信号位点数在天然种群中为23个,人工种群中为43.8个。Bayesian方法计算的期望杂合度在天然种群中为0.381,在人工种群中为0.184,2者差异显著。此外,根据Bayesian方法计算得到的杂合度推算的有效种群大小仅为1。遗传多样性分析结果显示,天然种群遗传多样性很低,估计是物种自身特点和人为的栖息地破坏共同导致的结果。根据天目铁木生活史各阶段对环境的要求,可以推测濒危前,该物种可能以分散的小种群存在,其遗传多样性受到分布模式的影响。人为破坏发生之后,由于仅有1个种群的部分个体幸存,遗传多样性大量丢失。在人工种群中更高的无信号位点数显示,纯合隐性基因型比例增加明显,相应地,杂合度也下降明显。推测其原因可能为天然种群中的亲本双方遗传差异过低,造成了类似近交引起的纯合基因型比例上升。因为纯合基因型比例上升,天然个体和人工个体之间共同拥有的条带数目减少,最终天然个体和人工个体之间在遗传上相似性下降。基于Jaccard相似性系数的在聚类分析表明,天然个体和人工个体基本上各自聚为一个分支。亲本分析的结果显示,所有天然个体都拥有一定数量的后代。但是不同亲本组合的后代数量差别很大,从仅有1个到30多个不等。根据亲本间的Jaccard相似性,排除了种子采集当年不同个体结实情况的影响后,发现可能存在亲本对之间的遗传相似性高,子代数量少的模式。