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茯苓[Wolfporia cocos(Schw.) Ryv. et Gilbn.]为我国传统常用中药材之一，广泛用于中成药及保健食品生产中，具有较高的经济价值。茯苓人工栽培长期以来一直是采用松木进行段木栽培，所用栽培菌株主要依靠野生菌株驯化而来。为了充分利用我国丰富的茯苓种质资源，减少茯苓栽培对松木资源的消耗，充分利用松木屑和农作物秸秆废料资源，本课题采用酯酶同工酶和ISSR分子标记技术，对我国茯苓栽培菌株及部分野生菌株的遗传多样性进行了分析，并开展了茯苓代料栽培技术的研究。主要研究结果如下：对茯苓27个供试菌株进行酯酶同工酶分析，共检测到了186条酯酶同工酶谱带，每个菌株所具有的酶带数为5～9条不等，多数为6～8条，27个供试菌株共有17种酶谱类型，其中部分菌株之间酶谱完全相同。聚类分析结果表明，在81％的相似水平上，供试的27个菌株可分为七个大类。第一类：Y1(宝山)、云苓1号、5.78、茯苓3号、A9、A10、岳西、T1、901、Z(z)、50864、靖洲28、GD和GZ；第二类：P0、华中、鄂1号和茯苓28；第三类：SD；第四类：50478、神苓1号(S1)、SC、50876和DB；第五类有：闽006号；第六类有：L；第七类：Z(1)。部分菌株之间相似系数为1.0，表明它们亲缘关系很近，这些菌株可能存在同物异名现象。采用来源不同的4个茯苓菌株对40个ISSR引物进行筛选，选择扩增稳定、多态性较好的12个引物用于ISSR分析。在正交优化扩增体系和筛选退火温度的基础上，用12条引物对27个茯苓菌株进行ISSR指纹图谱分析，共扩增出85条DNA带，其中多态性带64条，占总带数的75.29％，平均每个引物扩增出7.1条带。聚类分析表明，在82％的相似水平上，27个茯苓菌株可分为六个大类。第一类：Y1(宝山)、A9、50478、Z(z)、鄂1号、Z(1)、50864、DB、901、5.78、GZ、GD、云苓1号、茯苓3号、岳西、华中、茯苓28、靖洲28、A10、T1；第二类：野生菌株P0和闽006号；第三类：山东SD；第四类：安徽的野生菌株L；第五类：50876和S1；第六类：四川的SC菌株。ISSR分析进一步验证了酯酶同工酶分析的结果，同时也弥补了酯酶同工酶在蛋白质水平上分析的不足。ISSR和酯酶同工酶分析的结果，同时将野生菌株L、山东菌株SD及福建菌株闽006各自划为独立的三个类群中，并且均将GZ和GD，云苓1号和茯苓3号，Z(z)和50864，S1与50876等菌株归为相似系数较高的同类中。但ISSR分析结果与酯酶同工酶分析结果在一定程度上也存在着差异。本研究首次应用ISSR标记技术对茯苓进行菌株鉴定和种质资源多样性分析，表明ISSR标记技术具有简便、高效，多态性高，重复性好的特点，在茯苓菌株鉴别及亲缘关系分析中具有较高的应用价值。茯苓代料栽培技术研究表明，以松木屑、松木碎块作为代料栽培的主要原料，采用栽培地搭置低矮简易棚，试验效果较好，其茯苓引疤接种成活率达92.85％，平均生物学效率达18.25％，与段木栽培对照处理的结果接近，茯苓代料栽培首次试验取得初步成功。棚室栽培和大田露地栽培的效果，较大田低矮简易棚略差；以松木屑、松木碎块为主要栽培原料的配方，栽培效果优于以棉籽壳、松木碎块为主要栽培原料的配方。茯苓代料栽培技术的研究有待进一步的深入。