随着社会的快速发展，新的公共事务不断产生，传统官僚制组织模式越来越无力应对繁杂多变的公共事务，西方国家掀起的新公共管理改革也面临导致政府碎片化、空心化的挑战，在对新公共管理进行反思、批判和扬弃之后，英国政府又进行了协同政府改革，进而有了后来的“整体政府”。也正是在这样的时代背景和中国自身的行政体制下，中国政府试图通过联合执法、行政协助、综合执法等方法来解决行政执法实践中屡见不鲜的行政执法权限冲突问题，但都受限于方法自身的局限性。尽管学界对行政执法颇有研究，也不乏在联合执法、综合执法方面的研究，但专门对行政执法权限冲突理论与实践的研究却不多。关于协同政府和整体政府方面的研究，我国也处于起步阶段，跨部门协同在我国尚属于一个较新的课题。本文在充分认识西方行政体制改革变迁的基础上，尤其是对传统官僚制、新公共管理改革、大部制、协同政府和整体政府的内涵和特征有了清楚的了解后，汲取了协同政府和整体政府的精要，并以社会冲突理论、政治冲突理论、协同治理理论、资源依赖理论和整体性治理理论为理论支撑，结合中国政府体制的特点，分析了我国解决行政执法权限冲突方法的局限性，以“跨部门协同”为视角来探讨解决行政执法权限冲突问题，阐释了行政执法权限冲突的内涵、特征、产生的原因和影响，揭示了跨部门协同的内涵和特征，还将博弈论运用到跨部门协同的构建中，分析了构建跨部门协同的阻力和动力，并最终建构起一套理论实践模型。首先，论述了行政执法权限冲突的基本理论，以社会冲突理论、政治冲突理论为理论支撑，以图示的方式解析并归纳了行政执法权限冲突的概念和特征，描述了行政执法权限冲突的表现方式和类型，然后从法律、权力、公共事务等方面来解释行政执法权限冲突产生的原因，并分析了其积极和消极两方面的影响。其次，分析当前我国行政执法权限冲突解决方法及局限性，介绍了行政协助、联合执法、综合执法等方法的成效和不足之处，肯定了其在解决行政执法权限冲突问题上的积极作用，也指出了这些方法并未使我国“多龙治水”的局面得到彻底解决，必须要进行更高层次的探索，要实现在如何不打破权力边界，保持职能分工的前提下实现部门之间真正的协同。再次，介绍了跨部门协同从缘起到发展的过程，深刻剖析了传统官僚制面临的危机和新公共管理面临的挑战，并以协同治理理论、资源依赖理论和整体性治理理论为支撑，在对“跨部门协同”相关概念进行辨析的基础上，揭示了跨部门协同的含义与特征。然后再辅之以博弈论的分析视角，分析了形成跨部门协同的阻力和动力，并提出策略来增加跨部门协同形成的可能性。最后，分析了跨部门协同的组织实施过程，设计和建构了跨部门协同的理论实践模型。以协同意愿、政策论坛、战略理念、跨部门协同组织来搭建跨部门协同的框架，将目标协同、政策协同、价值观协同、服务供给协同、手段协同、文化协同六个方面作为跨部门协同的组成要素，并施以法律、政策、技术、契约和物质五个条件的保障，再建立起信任机制、合作机制、协调机制、监督机制、共享机制和分担机制，最后组织实施。